Pyrosequencing of bacterial 16S rRN

Pyrosequencing of bacterial 16S rRNA was undertaken to assess diversity in microbial communities of Pacific and Sydney rock oysters during storage. Pyrosequencing yielded 112,624 sequences (after quality trimming) from the 18 oyster samples analysed. The minimum sequence reads per sample was 1325, the maximum was 17,355 and the mean number of reads was 6256.
At the phyla level (Fig. 4), the bacterial profile of fresh Pacific oysters was dominated by Proteobacteria (58%) and Tenericutes (42%). The initial profile of fresh Sydney rock oysters was similar to Pacific oysters, although Proteobacteria (14%) represented a smaller proportion of the profile with increased abundance of Tenericutes (53%) and Spirochetes (27%). However, by Day 7 the microbial profiles of spoiled Pacific and Sydney rock oysters were nearly exclusively dominated by Proteobacteria (95% and 99% respectively).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Pyrosequencing ของแบคทีเรีย 16S rRNA ดำเนินการประเมินความหลากหลายทางชีวภาพในชุมชนจุลินทรีย์ของแปซิฟิกและซิดนีย์หินหอยนางรมระหว่างการเก็บรักษา Pyrosequencing หาลำดับ 112,624 (หลังจากตัดแต่งคุณภาพ) จากตัวอย่าง 18 หอย analysed อ่านลำดับต่ำสุดต่ออย่าง 1325, 17,355 ได้สูงสุด และจำนวนผู้อ่านหมายถึงเป็น 6256ที่ระดับ phyla (Fig. 4), โพแบคทีเรียของหอยแปซิฟิกถูกครอบงำ โดย Proteobacteria (58%) และ Tenericutes (42%) ส่วนกำหนดค่าเริ่มต้นของหอยหินซิดนีย์ได้คล้ายกับหอยนางรมแปซิฟิก แม้ว่า Proteobacteria (14%) แสดงสัดส่วนขนาดเล็กของโพรไฟล์ที่ มีความอุดมสมบูรณ์เพิ่มขึ้น Tenericutes (53%) และ Spirochetes (27%) อย่างไรก็ตาม โดย 7 วัน โพรไฟล์การจุลินทรีย์บูดแปซิฟิกและซิดนีย์หินหอยนางรมได้เกือบเฉพาะครอบงำ โดย Proteobacteria (95% และ 99% ตามลำดับ)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

pyrosequencing ของแบคทีเรีย 16S rRNA มีวัตถุประสงค์เพื่อประเมินความหลากหลายในกลุ่มจุลินทรีย์ของมหาสมุทรแปซิฟิกและซิดนีย์หอยหินระหว่างการเก็บรักษา pyrosequencing ผล 112,624 ลำดับ (หลังจากตัดแต่งที่มีคุณภาพ) จาก 18 ตัวอย่างหอยนางรมวิเคราะห์ ลำดับขั้นต่ำอ่านต่อตัวอย่างเป็น 1325 สูงสุดเป็น 17,355 และจำนวนเฉลี่ยของการอ่านเป็น 6256
ในระดับไฟลัม (รูปที่. 4), รายละเอียดแบคทีเรียในหอยนางรมแปซิฟิกได้รับการครอบงำโดยโปรตีโอแบคทีเรีย (58%) และ Tenericutes ( 42%) รายละเอียดแรกของซิดนีย์สดหอยนางรมก็คล้ายคลึงกับหอยนางรมแปซิฟิกแม้ว่า Proteobacteria (14%) คิดเป็นสัดส่วนที่เล็กกว่าของรายละเอียดมีความอุดมสมบูรณ์เพิ่มขึ้นของ Tenericutes (53%) และ Spirochetes (27%) อย่างไรก็ตามวัน 7 โปรไฟล์จุลินทรีย์เสียแปซิฟิกและซิดนีย์หอยหินเกือบถูกครอบงำโดยเฉพาะ Proteobacteria (95% และ 99% ตามลำดับ)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไพโรซีเควนซิงแบคทีเรียเบส 16S rRNA มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาความหลากหลายของจุลินทรีย์ในชุมชนและซิดนีย์ร็อคหอยนางรมแปซิฟิกในระหว่างการเก็บรักษา ไพโรซีเควนซิงให้ผล 112624 ลำดับ ( หลังตัดแต่งคุณภาพจากหอยนางรมจำนวน 18 คน ลำดับต่ำสุดอ่านต่อจำนวน 1048 , สูงสุดคือ 17355 และหมายถึงจำนวนของคนอ่านก็ 6256 .
ระดับไฟลัม ( รูปที่ 4 )โปรไฟล์ของเชื้อแบคทีเรียในหอยนางรมแปซิฟิกสดถูกครอบงำโดยโพรทีโอแบคทีเรีย ( 58 ) และ tenericutes ( 42% ) รายละเอียดเบื้องต้นของหอยนางรมซิดนีย์ร็อคสดเหมือนหอยนางรมแปซิฟิก ถึงแม้ว่าโพรทีโอแบคทีเรีย ( 14% ) ที่แสดงสัดส่วนเล็ก ๆของโปรไฟล์กับการเพิ่มความอุดมสมบูรณ์ของ tenericutes ( 53% ) และสไปโรคีท ( 27% ) อย่างไรก็ตามโดยวันที่ 7 โปรไฟล์ของจุลินทรีย์เน่าแปซิฟิกและซิดนีย์ร็อคหอยนางรมเป็นเกือบเฉพาะ dominated โดยโพรทีโอแบคทีเรีย ( 95% และ 99% ตามลำดับ )