3.2. Expression profiling of PHYPk

3.2. Expression profiling of PHYPk gene
Based on the identified sequence of phytase gene, primers for PHYPk
were developed. Fig. 2 reports the nucleotide and deduced amino acid
sequence of PHYPk, together with the primer positions used in this
study. The amino acid sequence contained the N-terminal and C-terminal
motifs (RHGXRX and HD) and the N-linked glycosylation sites. A
start codon, codifying a methionine, was identified as the beginning of
the protein, but no stop-codon was found in suitable place inside contig
396. Primers were designed to amplify the 793 to 970 nucleotide position
on contig 396, containing RHGXRXP motif (Fig. 2). Fig. 3 presents
the results of the PHYPk expression profiling in Delft Phy (yA) and
Delft+ (yB), normalized to t0, for the four positive strains (G6, G5,
M31 and M30). As seen in Fig. 3, the level of PHYPk expression was
strain dependent and significantly lower in the Delft+ medium than
in the Delft Phy medium for all P. kudriavzevii strains. However, for
strain G6 PHYPk was expressed significantly higher in the Delft+ than
for the Delft Phymedium fromt10. For growth in the Delft Phymedium,
different PHYPk expression patterns were observed among the four
strains of P. kudriavzevii. For strains G6, M31 and M30 PHYPk were
strongly up-regulated at the very beginning of the growth phase i.e. t2,
where after a down-regulation was observed. For strain G5 a transient
response in PHYPk expression was observed withmaximumexpression
at t8. For growth in the Delft+ medium, PHYPk expression was upregulated
at t10 for strain G6 and t48 for strain M31 whereas practically
no up-regulation was observed for strains G5 and M30. Significant differences
were detected between media for each strain, except for the

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.2 การนิพจน์สร้างโพรไฟล์ของยีน PHYPkตามลำดับที่ระบุของคุณสมบัติยีน ไพรเมอร์สำหรับ PHYPkได้รับการพัฒนา Fig. 2 รายงานนิวคลีโอไทด์และกรดอะมิโน deducedลำดับของ PHYPk พร้อมกับตำแหน่งรองพื้นใช้ในที่นี้ศึกษา ลำดับกรดอะมิโนประกอบด้วยเทอร์มินัล N และ C-เทอร์มินัลโดดเด่น (RHGXRX และ HD) และไซต์เชื่อมโยง N glycosylation Aระบุรหัสพันธุกรรมเริ่มต้น มี methionine, codifying เป็นต้นมีการค้นพบโปรตีน แต่ไม่หยุดรหัสพันธุกรรมที่เหมาะสมภายใน contig396. ไพรเมอร์ออกแบบมาเพื่อขยายตำแหน่งนิวคลีโอไทด์ 793-970บน contig 396 ประกอบด้วยแปลน RHGXRXP (Fig. 2) นำเสนอ fig. 3ผลของการ PHYPk นิพจน์สร้างโพรไฟล์ใน Phy Delft (ยา) และDelft + (yB), ตามปกติ t0 สำหรับการสี่บวกสายพันธุ์ (G6, G5M31 ก M30) เห็นใน Fig. 3 ระดับของนิพจน์ PHYPk ถูกสายพันธุ์ต่ำ และขึ้นอยู่ในกลาง Delft + มากกว่าในกลาง Delft Phy ในสายพันธุ์ P. kudriavzevii ทั้งหมด อย่างไรก็ตาม สำหรับต้องใช้ G6 PHYPk ได้แสดงออกอย่างมีนัยสำคัญสูงกว่าใน Delft + มากกว่าสำหรับ fromt10 Delft Phymedium สำหรับการเติบโตใน Delft Phymediumรูปแบบนิพจน์ PHYPk สุภัคระหว่างสี่สายพันธุ์ของ P. kudriavzevii สำหรับสายพันธุ์ G6, M31 และ M30 PHYPk ได้ขอขึ้นควบคุมที่เริ่มต้นของระยะการเจริญเติบโตเช่น t2ซึ่งหลังจากลงระเบียบถูกตรวจสอบ การต้องใช้ G5 เป็นแบบฉับพลันตอบสนองในนิพจน์ PHYPk ถูกตรวจสอบ withmaximumexpressionที่ t8 การเจริญเติบโตในสื่อ Delft + นิพจน์ PHYPk เป็น upregulatedที่อาคาร t10 สำหรับต้องใช้ G6 และ t48 สำหรับสายพันธุ์ M31 ในขณะที่ในทางปฏิบัติระเบียบขึ้นไม่ถูกตรวจสอบสำหรับสายพันธุ์ G5 และ M30 ความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญพบระหว่างสื่อสำหรับแต่ละต้องใช้ ยกเว้นการ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.2 โปรไฟล์การแสดงออกของยีน PHYPk
ขึ้นอยู่กับลำดับของยีนระบุ phytase ไพรเมอร์สำหรับ PHYPk
ได้รับการพัฒนา มะเดื่อ. 2
รายงานเบื่อหน่ายและกรดอะมิโนอนุมานลำดับของPHYPk
พร้อมกับตำแหน่งไพรเมอร์ที่ใช้ในการนี้การศึกษา ลำดับกรดอะมิโนที่มี N-terminal และ
C-ขั้วลวดลาย(RHGXRX และ HD) และเว็บไซต์ glycosylation N-เชื่อมโยง
codon เริ่มต้นหมวดหมู่ methionine
ที่ถูกระบุว่าเป็นจุดเริ่มต้นของโปรตีนแต่ไม่มีหยุด codon พบในสถานที่ที่เหมาะสมภายใน contig
396 ไพรเมอร์ถูกออกแบบมาเพื่อขยาย 793-970
ตำแหน่งเบื่อหน่ายในcontig 396 มีบรรทัดฐาน RHGXRXP (รูปที่. 2) มะเดื่อ. 3 นำเสนอผลการโปรไฟล์ PHYPk แสดงออกใน Delft Phy (YA) และเดลฟ์+ (YB) ปกติ t0 สำหรับสายพันธุ์ที่สี่บวก (G6, G5, M31 และ M30) เท่าที่เห็นในรูป 3 ระดับของการแสดงออก PHYPk เป็นสายพันธุ์ขึ้นอย่างมีนัยสำคัญและลดลงในสื่อDelft + กว่าในกลางDelft Phy สำหรับทุกสายพันธุ์พี kudriavzevii แต่สำหรับสายพันธุ์ G6 PHYPk ได้แสดงออกอย่างมีนัยสำคัญที่สูงขึ้นในเมืองเดลฟ์ + กว่าสำหรับDelft Phymedium fromt10 สำหรับการเจริญเติบโตในเมืองเดลฟ์ Phymedium, รูปแบบการแสดงออกที่แตกต่างกัน PHYPk ถูกตั้งข้อสังเกตในหมู่สี่สายพันธุ์ของพีkudriavzevii สำหรับสายพันธุ์ G6, M31 และ M30 PHYPk เป็นอย่างยิ่งขึ้นควบคุมที่จุดเริ่มต้นของระยะการเจริญเติบโตเช่นt2, ที่หลังจากที่กฎระเบียบลงพบว่า สำหรับ G5 ความเครียดชั่วคราวการตอบสนองในการแสดงออกPHYPk พบว่า withmaximumexpression ที่ T8 สำหรับการเจริญเติบโตในกลาง Delft + แสดงออก PHYPk ถูก upregulated ที่ t10 สำหรับ G6 ความเครียดและ t48 สำหรับสายพันธุ์ M31 ขณะที่ในทางปฏิบัติไม่มีระเบียบขึ้นพบว่าสายพันธุ์G5 และ M30 แตกต่างที่สำคัญได้รับการตรวจพบระหว่างสื่อแต่ละสายพันธุ์ยกเว้น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.2 . แบบแผนการแสดงออกของยีน phypk
ตามระบุลำดับของยีน phytase , ไพรเมอร์สำหรับ phypk
ได้รับการพัฒนา รูปที่ 2 รายงานลำดับเบสและลำดับกรดอะมิโนได้
phypk ร่วมกับรองพื้นตำแหน่งที่ใช้ในการศึกษาครั้งนี้

ลำดับกรดอะมิโน มีกรดอะมิโน และลวดลายซึ่ง
( rhgxrx และ HD ) และ n-linked glycosylation เว็บไซต์ รหัสพันธุกรรมเริ่มต้นเป็น
,การควบคุมแบบปรอทที่ถูกระบุว่าเป็นจุดเริ่มต้นของ
โปรตีน แต่ไม่มีรหัสหยุดที่พบในสถานที่ที่เหมาะสมภายใน contig
396 . ไพรเมอร์ที่ออกแบบมาเพื่อขยาย 793 ถึง 970 นิวคลีโอไทด์ตำแหน่ง
บน contig 396 ที่มี rhgxrxp แม่ลาย ( รูปที่ 2 ) รูปที่ 3 แสดงผลของ phypk
แบบแผนการแสดงออกในเดลฟต์ phy ( ยา ) และเดลฟท์ ( YB ) ปกติ
t0 ให้ ,สำหรับสี่บวกสายพันธุ์ ( G6 G5
, การพิมพ์และ M30 ) ตามที่เห็นในรูปที่ 3 , ระดับของการแสดงออก phypk คือ
เมื่อย และลดลงอย่างมีนัยสำคัญใน Delft ในเดลฟต์กลางกว่า
phy ( หน้า kudriavzevii สายพันธุ์ทั้งหมด อย่างไรก็ตาม สำหรับ phypk G6
เมื่อยได้สูงกว่าในเดลฟต์กว่า
สำหรับเดลฟต์ phymedium fromt10 . สำหรับการเติบโตใน เดลฟท์ phymedium
,รูปแบบการแสดงออกที่แตกต่างกัน พบว่ามี phypk ทั้ง 4
สายพันธุ์ของหน้า kudriavzevii . สำหรับสายพันธุ์และ M30 มี G6 M31 , phypk
ขอกระตุ้นที่จุดเริ่มต้นของการเจริญเติบโตระยะคือ 2
ที่หลัง down-regulation ถูกสังเกต สำหรับสายพันธุ์ G5 การตอบสนองชั่วคราว
ในการแสดงออก phypk พบ withmaximumexpression
ที่ T8 . สำหรับการเติบโตใน เดลฟท์ ขนาดกลางการแสดงออก phypk คือ upregulated
ที่ t10 สำหรับความเครียดและความเครียดและ t48 G6 สำหรับการพิมพ์จริง
ไม่ขึ้นระเบียบเป็นสังเกตสำหรับสายพันธุ์ G5 และ M30 ความแตกต่างระหว่างสื่อ
พบสำหรับแต่ละสายพันธุ์ ยกเว้น