Use of the 16S rRNA gene as a marke

Use of the 16S rRNA gene as a marker enables a wide variety
of bacteria in different ecological niches to be recorded.
Currently, pyrosequencing, which is a new technology of
sequencing by synthesis, is used worldwide. This method can
identify a much higher number of sequences to reveal the
diversity of the microbial community at a lower cost than
the Sanger method (Sogin et al., 2006). Pyrosequencing of
PCR amplicons from variable regions of the 16S rRNA gene
has recently enabled deep bacterial diversity surveys (> 1,000
phylotypes) in oceans (Sogin et al., 2006; Rusch et al., 2007),
freshwater lakes (Pope and Patel, 2008; Debroas et al., 2009;
Oh et al., 2011), and thermal springs (Gumerov et al., 2011).
Studies of the Baikal biota by means of pyrosequencing have
recently been started (Gladkikh et al., 2011; Kadnikov et al.,
2012). Comparative studies of phylotype diversity in plankton
and fouling on steel plate have shown that the communities
have similar primary bacterial phyla, but differing structures
(Gladkikh et al., 2011; Parfenova et al., 2013). An extremely
high percentage of the planktonic cyanobacteria, Synechococcus
spp., was recorded in deep methane hydrate-bearing
sediments dominated by methanotrophic bacteria (Kadnikov
et al., 2012). Analysis of microbial biofilms using pyrosequencing
is of significance to both the water suppliers and
consumers; however, ecological and microbiological inves-tigations are rarely performed, and focused on surveys of
the bacterial species diversity of biofilms that form in marine
(Narváez-Zapata, 2005; Edwards et al., 2010; Mobberley et
al., 2012) and extreme ecosystems (Thibault et al., 2010; Klatt
et al., 2011).
Therefore, this study was conducted to investigate cyanobacterial
communities inhabiting different types of substrates
at the bottom of Lake Baikal in the littoral zone using microscopic
methods and pyrosequencing of a 16S rRNA gene
fragment.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ใช้ของ 16S rRNA ยีนเครื่องหมายช่วยให้หลากหลายของแบคทีเรียในตรงไหนระบบนิเวศต่าง ๆ การบันทึกปัจจุบัน pyrosequencing ซึ่งเป็นเทคโนโลยีใหม่ของลำดับเบส โดยการสังเคราะห์ การผลิตทั่วโลก วิธีนี้สามารถระบุมากสูงหมายเลขลำดับที่แสดงในความหลากหลายของจุลินทรีย์ที่มีต้นทุนต่ำกว่าวิธี Sanger (Sogin และ al., 2006) Pyrosequencing ของAmplicons PCR จากภูมิภาคผันแปรของยีนใน rRNA 16Sล่าสุดได้เปิดสำรวจความหลากหลายทางชีวภาพแบคทีเรียลึก (> 1000phylotypes) ในมหาสมุทร (Sogin และ al., 2006 Rusch et al., 2007),ทะเลสาบน้ำจืด (สมเด็จพระสันตะปาปาและ Patel, 2008 Debroas et al., 2009Oh et al., 2011), และน้ำพุร้อน (Gumerov et al., 2011)มีการศึกษาสิ่งสาบไบคาลโดย pyrosequencingรับเริ่มต้น (Gladkikh et al., 2011 Kadnikov et al.,2012) ศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลาย phylotype ในแพลงก์ตอนและ fouling บนแผ่นเหล็กได้แสดงที่ชุมชนมี phyla แบคทีเรียหลักคล้ายกัน แต่โครงสร้างแตกต่างกัน(Gladkikh et al., 2011 Parfenova et al., 2013) เป็นอย่างมากของ planktonic cyanobacteria, Synechococcusโอ บันทึกในมีเทนลึกเรืองผับ/เลาจน์ตะกอนที่ครอบงำ โดย methanotrophic แบคทีเรีย (Kadnikovร้อยเอ็ด al., 2012) การวิเคราะห์จุลินทรีย์ biofilms ใช้ pyrosequencingเป็นสำคัญทั้งผู้จำหน่ายน้ำ และผู้บริโภค อย่างไรก็ตาม ทางจุลชีววิทยา และระบบนิเวศ inves tigations จะไม่ค่อยทำ และเน้นการสำรวจหลากหลายสายพันธุ์แบคทีเรีย biofilms ที่ในทะเล(Narváez-Zapata, 2005 เอ็ดเวิร์ด et al., 2010 Mobberley ร้อยเอ็ดal., 2012) และระบบนิเวศมาก (Thibault et al., 2010 Klattร้อยเอ็ด al., 2011)ดังนั้น ศึกษานี้ได้ดำเนินการตรวจสอบ cyanobacterialชุมชนที่อาศัยอยู่แตกต่างกันของพื้นผิวที่ด้านล่างของทะเลสาบไบคาลใน littoral โซนโดยใช้กล้องจุลทรรศน์วิธีการและ pyrosequencing เป็น 16S rRNA ยีนส่วน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ใช้ 16S rRNA ยีนเป็นเครื่องหมายช่วยให้ความหลากหลาย
ของแบคทีเรียในนิเวศที่แตกต่างกันจะได้รับการบันทึกไว้.
ปัจจุบัน pyrosequencing ซึ่งเป็นเทคโนโลยีใหม่ของ
การเรียงลำดับโดยสังเคราะห์ใช้ทั่วโลก วิธีการนี้จะสามารถ
ระบุจำนวนที่สูงมากของลำดับที่จะเปิดเผย
ความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ในราคาที่ต่ำกว่า
วิธีการแซงเจอร์ (Sogin et al., 2006) pyrosequencing ของ
amplicons PCR จากภูมิภาคตัวแปรของยีน 16S rRNA
ได้เปิดใช้งานเมื่อเร็ว ๆ นี้ลึกสำรวจความหลากหลายของเชื้อแบคทีเรีย (> 1,000
phylotypes) ในมหาสมุทร (Sogin et al, 2006;. Rusch et al, 2007.),
ทะเลสาบน้ำจืด (สมเด็จพระสันตะปาปาและเทล 2008 ; Debroas et al, 2009;.
... โอ้ et al, 2011) และบ่อน้ำพุร้อน (Gumerov et al, 2011)
การศึกษาสิ่งมีชีวิตไบคาลโดยใช้วิธีการ pyrosequencing ได้
รับการเริ่มต้นเมื่อเร็ว ๆ นี้ (Gladkikh et al, 2011;. Kadnikov et al.,
2012) การศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายของแพลงก์ตอนใน phylotype
และเปรอะเปื้อนบนแผ่นเหล็กได้แสดงให้เห็นว่าชุมชน
มี phyla แบคทีเรียที่คล้ายกันหลัก แต่โครงสร้างที่แตกต่างกัน
(Gladkikh et al, 2011;.. Parfenova, et al, 2013) มาก
เปอร์เซ็นต์สูงของไซยาโนแบคทีเรีย planktonic, Synechococcus
spp. ได้รับการบันทึกในมีเทนไฮเดรตลึกแบก
ตะกอนครอบงำโดยแบคทีเรีย methanotrophic (Kadnikov
et al., 2012) การวิเคราะห์โดยใช้จุลินทรีย์ไบโอฟิล์ม pyrosequencing
มีความสำคัญกับทั้งซัพพลายเออร์น้ำและ
ผู้บริโภค แต่นิเวศวิทยาและจุลชีววิทยา INVES-tigations จะดำเนินการไม่ค่อยและมุ่งเน้นไปที่การสำรวจของ
สายพันธุ์แบคทีเรียหลากหลายของไบโอฟิล์มที่ก่อตัวในทะเล
(Narváez-เปาลา, 2005; เอ็ดเวิร์ดส์, et al, 2010;. Mobberley และ
อัล, 2012.) และรุนแรง ระบบนิเวศ (ธีโบลท์และคณะ, 2010;. Klatt
et al., 2011).
ดังนั้นการศึกษาครั้งนี้ได้ดำเนินการในการตรวจสอบไซยาโนแบคทีเรีย
ที่อาศัยอยู่ในชุมชนที่แตกต่างกันของพื้นผิว
ที่ด้านล่างของทะเลสาบไบคาลในบริเวณโซนโดยใช้กล้องจุลทรรศน์
วิธีการและ pyrosequencing ของ 16S rRNA ยีน
ส่วน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้ของ 16S rRNA เป็นยีนเครื่องหมายช่วยให้ความหลากหลายของแบคทีเรียใน niches นิเวศที่แตกต่างกัน

ปัจจุบันจะถูกบันทึกไว้ ไพโรซีเควนซิง ซึ่งเป็นเทคโนโลยีใหม่ของ
จัดลำดับโดยการสังเคราะห์จะใช้ทั่วโลก วิธีนี้สามารถระบุหมายเลขสูงมาก

ลำดับเปิดเผยความหลากหลายของชุมชนจุลินทรีย์ที่ต้นทุนต่ำกว่า
วิธีแซงเกอร์ ( sogin et al . , 2006 )ไพโรซีเควนซิงของ
PCR amplicons จากตัวแปรภูมิภาคของ 16S rRNA ยีน
เพิ่งเปิดการสำรวจความหลากหลายของแบคทีเรียลึก ( > 1000
phylotypes ) ในมหาสมุทร ( sogin et al . , 2006 ; รัช et al . , 2007 ) ,
ทะเลสาบน้ำจืด ( สมเด็จพระสันตะปาปาและ Patel , 2008 ; debroas et al . , 2009 ;
. et al . , 2011 ) , และสปริงความร้อน ( gumerov et al . , 2011 ) .
การศึกษาของสิ่งมีชีวิต ( 1 ) ด้วยวิธีไพโรซีเควนซิงมี
เพิ่งเริ่ม ( gladkikh et al . , 2011 ; kadnikov et al . ,
2012 ) การศึกษาเปรียบเทียบความหลากหลายของแพลงก์ตอนและ phylotype
เหม็นบนแผ่นเหล็กได้แสดงให้เห็นว่าชุมชน
มีหลักแบคทีเรียทั้งหมด แต่เนื่องจากโครงสร้าง
( gladkikh et al . , 2011 ; parfenova et al . , 2013 ) อย่างมาก
สูงร้อยละของไซยาโนแบคทีเรียสิ่งมีชีวิตขนาดเล็กมากในน้ำซินโคคอคคัส
spp . ,ที่ถูกบันทึกไว้ในห้วงมีเทนไฮเดรตเรือง
ตะกอน dominated โดย methanotrophic แบคทีเรีย ( kadnikov
et al . , 2012 ) การวิเคราะห์จุลินทรีย์ไบโอฟิล์มใช้ไพโรซีเควนซิง
เป็นสำคัญ ทั้งน้ำและซัพพลายเออร์
ผู้บริโภค อย่างไรก็ตาม วิทยาและจุลชีววิทยา จัดการ tigations ไม่ค่อยแสดงและเน้นการสำรวจ
ของความหลากหลายของไบโอฟิล์มแบบฟอร์มที่ทะเล
( narv . kgm คือ ซาปาตา , 2005 ; เอ็ดเวิร์ด et al . , 2010 ;
mobberley et al . , 2012 ) และระบบนิเวศ ( extreme ติบอลต์ et al . , 2010 ; klatt
et al . , 2011 ) .
ดังนั้นการศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาระบบยูชุมชนที่อาศัยอยู่ในประเภทที่แตกต่างกันของพื้นผิว

ที่ด้านล่างของทะเลสาบไบคาลในโซนประเทศโดยใช้กล้องจุลทรรศน์
และวิธีไพโรซีเควนซิงของ 16S rRNA ยีน
เศษ .