Description of DFT calculationsAll

Description of DFT calculations
All DFT calculations were performed using the real-space projector augmented
wavefunction (PAW) method as implemented in the GPAW software package (18,19).
We employ the local density approximation (LDA) (17) to the exchange and correlation
(xc)-functional. Note that differences between the energetics obtained within the local
density approximation (LDA), generalized gradient approximation (GGA), or rangeseparated
hybrid xc-functionals are expected to be an order of magnitude smaller than the
energy of the most weakly bound transition state relative to the reactant following the
initial cyclization for each reaction pathway. Further, the LDA often provides superior
bond length and geometry predictions compared to more computationally expensive
methods, such as GGAs and hybrids. This suggests that LDA results are sufficiently
accurate for describing the chemical processes under consideration (32).
We perform Γ point calculations using a grid spacing of h = 0.2 Å, an electronic
temperature of kBT = 0.1 eV with all energies extrapolated to T = 0 K, and relax all
molecular structures until a maximum force below 0.05 eV/Å is obtained. Adsorption on
the Ag(100) surface is modeled using a 6×6×3 slab fixed to the experimental coordinates
obtained from a lattice parameter for Ag of 4.09 Å, and including more than 12 Å of
vacuum between the molecular layer and the repeated image of the Ag(100) slab. The
6×6×3 slab provides at least 4 Å of separation between repeated molecular images in the
surface plane. We find these values are sufficient to converge both energy differences and
the electron density for the systems under consideration.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

คำอธิบายของการคำนวณ DFTดำเนินการคำนวณ DFT ทั้งหมดใช้พื้นที่จริงโปรเจคเตอร์ออกเมนต์วิธี wavefunction (ตีน) เป็นดำเนินการในแพคเกจซอฟต์แวร์ GPAW (18,19)เราใช้ประมาณความหนาแน่นภายใน (LDA) (17) การแลกเปลี่ยนและความสัมพันธ์(xc) -ทำงาน โปรดสังเกตว่า ความแตกต่างระหว่างพลังได้รับภายในท้องถิ่นความหนาแน่นประมาณ (LDA), การตั้งค่าทั่วไปประมาณไล่ระดับสี (GGA), หรือ rangeseparatedไฮบริ xc-functionals คาดว่าจะมีขนาดของใบสั่งมีขนาดเล็กกว่าพลังงานส่วนใหญ่สูญผูกเปลี่ยนสถานะสัมพันธ์กับตัวทำปฏิกิริยาต่อไปนี้cyclization เริ่มต้นสำหรับทางเดินแต่ละปฏิกิริยา เพิ่มเติม LDA มักจะมีห้องตราสารหนี้เปรียบเทียบกับราคาแพงมาก computationally คาดคะเนความยาวและรูปทรงเรขาคณิตวิธี GGAs และลูกผสม นี้แนะนำว่า LDA ผลลัพธ์ไม่เพียงพอถูกต้องในกระบวนการทางเคมีภายใต้การพิจารณา (32)เราคำนวณΓจุดโดยใช้ระยะห่างระหว่างเส้นตารางของ h = 0.2 Å ทางอิเล็กทรอนิกส์อุณหภูมิของ kBT = 0.1 eV กับพลังงานทั้งหมด extrapolated ไป T = 0 K และผ่อนคลายทั้งหมดโครงสร้างระดับโมเลกุลจนถึงแรงสูงสุดต่ำกว่า 0.05 eV / Åได้รับการ ดูดซับบนจำลองพื้นผิว Ag(100) ใช้พื้น× 3 6 × 6 คงจะพิกัดทดลองได้จากพารามิเตอร์โครงตาข่ายประกอบ Ag 4.09 Å รวมกว่า 12 Åของสุญญากาศระหว่างชั้นโมเลกุลและภาพซ้ำของพื้น Ag(100) ที่6 × 6 × 3 พื้นให้น้อย 4 Åของการแยกระหว่างภาพซ้ำระดับโมเลกุลในการระนาบผิว เราหาค่าเหล่านี้จะเพียงพอที่จะมาบรรจบกันทั้งความแตกต่างของพลังงาน และความหนาแน่นอิเล็กตรอนในระบบภายใต้การพิจารณา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รายละเอียดของการคำนวณ DFT
การคำนวณ DFT ทั้งหมดถูกดำเนินการโดยใช้เครื่องฉายจริงพื้นที่เพิ่ม
wavefunction (PAW) วิธีการดำเนินการในขณะที่แพคเกจซอฟต์แวร์ GPAW (18,19).
เรามีพนักงานประมาณความหนาแน่นของท้องถิ่น (LDA) (17) เพื่อการแลกเปลี่ยนและ ความสัมพันธ์
(XC) -functional โปรดทราบว่าความแตกต่างระหว่างพลังที่ได้รับภายในท้องถิ่น
ประมาณความหนาแน่น (LDA) ประมาณลาดทั่วไป (GGA) หรือ rangeseparated
ไฮบริด XC-functionals คาดว่าจะมีลำดับความสำคัญน้อยกว่า
การใช้พลังงานของการเปลี่ยนแปลงมากที่สุดผูกพันรัฐอ่อนเมื่อเทียบกับ สารตั้งต้นดังต่อไปนี้
cyclization เริ่มต้นสำหรับการเดินแต่ละปฏิกิริยา นอกจากนี้ LDA มักจะให้ดีกว่า
ระยะเวลาในพันธบัตรและการคาดการณ์เรขาคณิตมากขึ้นเมื่อเทียบกับคอมพิวเตอร์ที่มีราคาแพง
วิธีการเช่น GGAs และลูกผสม นี้แสดงให้เห็นว่าผล LDA อยู่อย่างพอเพียง
ที่ถูกต้องสำหรับการอธิบายกระบวนการทางเคมีภายใต้การพิจารณา (32).
เราดำเนินการคำนวณจุดΓโดยใช้ระยะห่างตารางของชั่วโมง = 0.2, อิเล็กทรอนิกส์
อุณหภูมิ KBT = 0.1 eV กับพลังงานทั้งหมดที่จะประเมิน T = 0 K และผ่อนคลายทุก
โครงสร้างโมเลกุลจนกระทั่งแรงสูงสุดต่ำกว่า 0.05 eV / a จะได้รับ การดูดซับ
Ag (100) พื้นผิวเป็นแบบจำลองโดยใช้ 6 × 6 × 3 แผ่นจับจ้องไปที่พิกัดการทดลอง
ที่ได้รับจากตาข่ายพารามิเตอร์สำหรับ Ag 4.09 และรวมกว่า 12 ของ
สูญญากาศระหว่างชั้นโมเลกุลและภาพซ้ำ ของ Ag (100) แผ่น
6 × 6 × 3 แผ่นมีอย่างน้อย 4 ของการแยกระหว่างภาพโมเลกุลซ้ำใน
ระนาบพื้นผิว เราพบค่าเหล่านี้มีเพียงพอที่จะมาบรรจบกันทั้งความแตกต่างของพลังงานและ
ความหนาแน่นของอิเล็กตรอนสำหรับระบบภายใต้การพิจารณา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รายละเอียดของการคำนวณ DFT
การคำนวณ DFT มีการปฏิบัติการใช้โปรเจคเตอร์พื้นที่จริง Augmented
ฟังชันคลื่น ( ตีน ) วิธีที่ใช้ใน gpaw แพคเกจซอฟต์แวร์ ( 18,19 ) .
เราจ้างประมาณความหนาแน่นท้องถิ่น ( lda ) ( 17 ) เพื่อแลกเปลี่ยนและสหสัมพันธ์
( XC ) - หน้าที่ ทราบความแตกต่างระหว่างการนำได้รับภายในการประมาณความหนาแน่นท้องถิ่น
( lda )การไล่ระดับสีทั่วไปประมาณ ( ก๊ะ ) หรือ rangeseparated
ไฮบริดฟังก์ชันนี้ คาดว่าจะมีคำสั่งของขนาดที่มีขนาดเล็กกว่า
พลังงานของการเปลี่ยนสถานะที่สุดอย่างอ่อนผูกสัมพันธ์กับสารตั้งต้นตาม
อัลเริ่มต้นสำหรับแต่ละปฏิกิริยา . เพิ่มเติม lda มักจะมีความยาวพันธะดีกว่า
และการคาดการณ์มากขึ้น computationally แพง
เรขาคณิตเมื่อเทียบกับวิธีการ เช่น ggas และลูกผสม นี้แสดงให้เห็นว่าผล lda เพียงพอ
ถูกต้องอธิบายกระบวนการทางเคมีภายใต้การพิจารณา ( 32 ) .
เราทำการคำนวณจุดΓโดยใช้ตารางระยะ H = 0.2 กริพเพน , อิเล็กทรอนิกส์
อุณหภูมิของ kbt = 0.1 EV พลังงานคาดด้วย T = 0 K , และผ่อนคลายโครงสร้างโมเลกุลทั้งหมด
จนสูงสุด บังคับข้างล่าง 0.05 EV / กริพเพนจะได้รับการดูดซับบนพื้นผิว
AG ( 100 ) แบบใช้ 6 × 6 × 3 แผ่นแก้ไขพิกัดที่ได้จากการทดลอง
แลตทิซพารามิเตอร์สำหรับแต่ละรุ่นของกริพเพน และรวมถึงกว่า 12 กริพเพนของ
สุญญากาศระหว่างชั้นโมเลกุลและย้ำภาพลักษณ์ของ AG ( 100 ) พื้น
6 × 6 × 3 แผ่น มีอย่างน้อย 4 •แยกระหว่างโมเลกุลซ้ำภาพใน
พื้นผิวเครื่องบินเราพบคุณค่าเหล่านี้จะเพียงพอที่จะมาบรรจบกันทั้งพลังงานและความแตกต่าง
ความหนาแน่นของอิเล็กตรอนในระบบภายใต้การพิจารณา