Members of the Sphingomonas genus a

Members of the Sphingomonas genus are often isolated from petroleum-contaminated soils due to their unique abilities to degrade polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), which are important for in situ bioremediation. In this study, a combined phenotypic and geno- typic approach using streptomycin-containing medium and Sphingomonas-specific PCR was developed to isolate and identify culturable Sphingomonas strains present in petroleum- contaminated soils in the Shenfu wastewater irrigation zone. Of the 15 soil samples examined, 12 soils yielded yellow streptomycin-resistant colonies. The largest number of yellow colony-forming units (CFUs) could reach 105 CFUs g−1 soil. The number of yellow CFUs had a significant positive correlation (p < 0.05) with the ratio of PAHs to total petroleum hydrocarbons (TPH), indicating that Sphingomonas may play a key role in degrading the PAH fraction of the petroleum contaminants at this site. Sixty yellow colonies were selected ran- domly and analyzed by colony PCR using Sphingomonas-specific primers, out of which 48 isolates had PCR-positive signals. The 48 positive amplicons generated 8 distinct restriction fragment length polymorphism (RFLP) patterns, and 7 out of 8 phylotypes were identified as Sphingomonas by 16S rRNA gene sequencing of the representative strains. Within these 7 Sphingomonas strains, 6 strains were capable of using fluorene as the sole carbon source, while 2 strains were phenanthrene-degrading Sphingomonas. To the best of our knowledge, this is the first report to evaluate the relationship between PAHs contamination levels and culturable Sphingomonas in environmental samples.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สมาชิกประเภท Sphingomonas มักแยกจากดินปนเปื้อนน้ำมันเนื่องจากความสามารถเฉพาะการลดคีนนสูง (สาร PAHs), ซึ่งมีความสำคัญสำหรับววิธีในแหล่งกำเนิด ในการศึกษานี้ การรวมไทป์ และดาราดัง - วิธี typic ใช้ streptomycin ประกอบด้วยปานกลางและ PCR Sphingomonas specific ได้รับการพัฒนาการแยก และระบุ culturable Sphingomonas สายพันธุ์ที่มีอยู่ในปิโตรเลียม-ปนเปื้อนดินในเขตชลประทานน้ำเสีย Shenfu ตัวอย่างดิน 15 ตรวจสอบ ดิน 12 ผลโคโลทน streptomycin จำนวนหน่วยการอาณานิคมขึ้นรูปสีเหลือง (CFUs) ที่ใหญ่ที่สุดสามารถเข้าถึง 105 CFUs g−1 ดิน จำนวน CFUs สีเหลืองมีความสัมพันธ์ในเชิงบวกงมาก (p < 0.05) กับอัตราของกลุ่มไฮโดรคาร์บอนปิโตรเลียมรวม (TPH), ซึ่งบ่งชี้ว่า Sphingomonas อาจมีบทบาทสำคัญในการลดเศษผาปนปิโตรเลียมที่เว็บไซต์นี้ หกสิบโคโลได้เลือกวิ่ง domly และวิเคราะห์ โดยอาณานิคม PCR ที่ใช้ไพรเมอร์ Sphingomonas specific จากแยก 48 ซึ่งมีสัญญาณบวก PCR Amplicons บวก 48 8 ข้อจำกัดแตกต่างกันส่วนความยาวโพลิมอร์ฟิซึม (RFLP) รูปแบบที่สร้างขึ้น และ 7 จาก 8 phylotypes ก็ identified เป็น Sphingomonas โดย 16S rRNA ยีนลำดับสายพันธุ์แทน ภายในเหล่านี้สายพันธุ์ Sphingomonas 7, 6 สายพันธุ์มีความสามารถในการใช้ fluorene เป็นแหล่งคาร์บอนแต่เพียงผู้เดียว ในขณะที่สายพันธุ์ที่ 2 ถูกฟีแนนทรีนลด Sphingomonas ที่สุดความรู้ของเรา นี้เป็นรายงานแรกในการประเมินความสัมพันธ์ระหว่างระดับการปนเปื้อนสาร PAHs Sphingomonas culturable ในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สมาชิกประเภท Sphingomonas มักจะถูกแยกออกจากดินปนเปื้อนปิโตรเลียมเนื่องจากความสามารถของพวกเขาที่ไม่ซ้ำกันในการย่อยสลายไฮโดรคาร์บอน (PAHs) ซึ่งมีความสำคัญสำหรับการบำบัดทางชีวภาพในแหล่งกำเนิด ในการศึกษาครั้งนี้รวมกันและฟีโนไทป์ geno- วิธี Typic ใช้ streptomycin ที่มีขนาดกลางและ Sphingomonas-Fi speci C PCR ได้รับการพัฒนาเพื่อแยกและระบุสายพันธุ์ Sphingomonas culturable อยู่ในดินที่ปนเปื้อน petroleum- ในเขตชลประทานน้ำเสีย Shenfu 15 การตรวจสอบตัวอย่างดิน 12 ดินให้ผลสีเหลือง streptomycin ทนอาณานิคม จำนวนมากที่สุดของหน่วยอาณานิคมขึ้นรูปสีเหลือง (CFUs) สามารถเข้าถึง 105 CFUs G-1 ดิน จำนวน CFUs สีเหลืองมีนัยสำคัญ Fi ลาดเทความสัมพันธ์เชิงบวก (p <0.05) โดยมีอัตราส่วนของสาร PAHs เพื่อรวมปิโตรเลียมไฮโดรคาร์บอน (TPH) แสดงให้เห็นว่า Sphingomonas อาจมีบทบาทสำคัญในการย่อยสลายเศษ PAH สารปนเปื้อนปิโตรเลียมที่เว็บไซต์นี้ หกสิบอาณานิคมสีเหลืองได้รับการคัดเลือก domly ran- และวิเคราะห์โดยใช้วิธี PCR อาณานิคม Sphingomonas-Fi speci ไพรเมอร์คออกจากที่ 48 ไอโซเลทมีสัญญาณ PCR-บวก 48 amplicons บวกที่สร้างความแตกต่างที่แตกต่างกัน 8 ข้อ จำกัด ความยาวชิ้นส่วน (RFLP) รูปแบบและ 7 จาก 8 phylotypes เป็นเอ็ด Fi ระบุเป็น Sphingomonas โดย 16S rRNA ลำดับยีนของสายพันธุ์ตัวแทน เหล่านี้ภายใน 7 สายพันธุ์ Sphingomonas, 6 สายพันธุ์ที่มีความสามารถในการใช้ uorene ฟลอริด้าเป็นแหล่งคาร์บอน แต่เพียงผู้เดียวในขณะที่ 2 สายพันธุ์เป็นฟีแนนทรีย่อยสลาย Sphingomonas ที่ดีที่สุดของความรู้ของเรานี้เป็นรายงานแรกในการประเมินความสัมพันธ์ระหว่างระดับการปนเปื้อนสาร PAHs และ culturable Sphingomonas ในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สมาชิกของสกุล sphingomonas มักจะแยกจากดินปนเปื้อนน้ำมันจากความสามารถเฉพาะตัวของพวกเขาเพื่อย่อยสลายสารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน ( PAHs ) ซึ่งเป็นส่วนสําคัญใน situ ชีวภาพ . ในการศึกษานี้ได้รวมคุณสมบัติ และจีโน่ - วิธีการ typic ใช้ยารักษาที่มีขนาดกลาง และ sphingomonas speci จึง C PCR ถูกพัฒนาขึ้นเพื่อแยกและระบุ culturable sphingomonas สายพันธุ์ที่มีอยู่ในปิโตรเลียม - ดินปนเปื้อนในน้ำชลประทาน shenfu โซน ของ 15 ตัวอย่างดินทดสอบดินจำนวน 12 อาณานิคมทนจังสีเหลือง หมายเลขที่ใหญ่ที่สุดของโคโลนีสีเหลืองเป็นหน่วย ( cfus ) ได้ถึง 105 cfus G − 1 ดิน จำนวน cfus สีเหลืองมี signi จึงไม่สามารถความสัมพันธ์ทางบวกอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ( P < 0.05 ) กับอัตราส่วนของ PAHs ในปิโตรเลียมไฮโดรคาร์บอนทั้งหมด ( เพิ่ม ) แสดงว่า sphingomonas อาจมีบทบาทสำคัญในการทำให้ผ้าส่วนของปิโตรเลียม สารปนเปื้อนที่เว็บไซต์นี้ อาณานิคมหกสิบสีเหลืองที่วิ่ง - domly และวิเคราะห์โดยวิธี PCR ที่ใช้ไพรเมอร์ sphingomonas speci อาณานิคมจึงค อันมี 48 แยก PCR บวกสัญญาณ 48 บวก amplicons สร้าง 8 ที่แตกต่างกันการ fragment length polymorphism ( RFLP ) รูปแบบและ 7 จาก 8 phylotypes เป็น identi จึงเอ็ดเป็น sphingomonas เบส 16S rRNA ลำดับของยีนโดยตัวแทนของสายพันธุ์ ภายใน 7 sphingomonas สายพันธุ์ 6 สายพันธุ์มีความสามารถในการใช้fl uorene เป็นแหล่งคาร์บอน ในขณะที่ 2 สายพันธุ์ย่อยสลายฟีแนนทรีน sphingomonas . เพื่อที่ดีที่สุดของความรู้ของเรานี้เป็นรายงานแรกจึงเพื่อศึกษาความสัมพันธ์ระหว่างระดับการปนเปื้อนพีเอเอชและ sphingomonas culturable ในตัวอย่างสิ่งแวดล้อม