An anaerobic microbial consortium (

An anaerobic microbial consortium (referred to as ANAS) that reductively dechlorinates trichloroethene (TCE) completely to ethene with the transient production of cis-dichloroethene (cDCE) and vinyl chloride was enriched from contaminated soil obtained from Alameda Naval Air Station. ANAS uses lactate as its electron donor and has been functionally stable for over 2 years. Following a brief exposure to oxygen, a subculture (designated VCC) derived from ANAS could dechlorinate TCE only to vinyl chloride with lactate as its electron donor. Three molecular methods were used concurrently to characterize the community structure of ANAS and VCC:  clone library construction/clone sequencing, terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) analysis, and fluorescent in situ hybridization (FISH) with rRNA probes. The community structure of ANAS did not change significantly over the course of a single feeding/dechlorination cycle, and only minor fluctuations occurred over many feeding cycles spanning the course of 1 year. Clone libraries and T-RFLP analyses suggested that ANAS was dominated by populations belonging to three phylogenetic groups:  Dehalococcoides species, Desulfovibrio species, and members of the Clostridiaceae (within the low G + C Gram-positives). FISH results suggest that members of the Cytophaga/Flavobacterium/Bacteroides (CFB) cluster and high G + C Gram-positives (HGCs) were numerically important in ANAS despite their under-representation in the clone libraries. Parallel analyses of VCC samples suggested that Dehalococcoides species and Clostridiaceae were only minor populations in this community. Instead, VCC had increased populations of organisms in the β and γ subclasses of the Proteobacteria as well as significant populations of organisms in the CFB cluster. It is possible that symbiotic interactions are occurring between some of ANAS's phylogenetic groups under the enrichment conditions, including interspecies hydrogen transfer from Desulfovibrio species to Dehalococcoides species. However, the nucleic acid-based analyses performed here would need to be supplemented with chemical species data in order to test any hypotheses about functional roles of various community members. Additionally, these results suggest that an organism outside the Dehalococcoides genus may be capable of dechlorinating cDCE to vinyl chloride.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การไม่ใช้จุลินทรีย์ consortium (เรียกว่าอนัส) ที่ reductively dechlorinates trichloroethene (TCE) อย่างสมบูรณ์เพื่อ ethene ผลิตชั่วคราวของ cis-dichloroethene (cDCE) และไวนิลคลอไรด์ ถูกอุดมไปจากดินที่ปนเปื้อนได้จากอเมริกันกองทัพอากาศสถานี อนัสใช้ lactate เป็นผู้บริจาคของอิเล็กตรอน และมีฟังก์ชันมั่นคงปี 2 ต่อการสัมผัสสั้น ๆ ออกซิเจน วัฒนธรรม (VCC กำหนด) ที่มาจากอนัสสามารถ dechlorinate TCE เท่ากับไวนิลคลอไรด์กับ lactate เป็นผู้บริจาคของอิเล็กตรอน สามโมเลกุลวิธีใช้พร้อมกำหนดลักษณะโครงสร้างชุมชนของอนัสและ VCC: โคลนลำดับการก่อสร้าง/โคลนไลบรารี เทอร์มินัลจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (T-RFLP) วิเคราะห์ และเรืองแสงใน situ hybridization (ปลา) กับ rRNA คลิปปากตะเข้ โครงสร้างชุมชนของอนัสได้ไม่เปลี่ยนแปลงอย่างมากในช่วงรอบเดียวให้ อาหาร/dechlorination และเพียงเล็กน้อยความผันผวนที่เกิดขึ้นผ่านวงจรอาหารหลายรัฐหลักสูตร 1 ปี ไลบรารีการโคลนและการวิเคราะห์ T RFLP แนะนำว่า อนัสถูกครอบงำ โดยประชากรของกลุ่มสาม phylogenetic: Dehalococcoides พันธุ์ พันธุ์ Desulfovibrio และสมาชิกของ Clostridiaceae (ภายในต่ำ G + C กรัมทำงานผิดพลาด) ผลปลาแนะนำว่า สมาชิกของคลัสเตอร์ Cytophaga Flavobacterium/Bacteroides (CFB) และสูง G + C กรัมทำงานผิดพลาด (HGCs) มีความสำคัญเรียงตามตัวเลขในอนัสแม้ตัวแทนน้อยในไลบรารีโคลน วิเคราะห์คู่ขนานอย่าง VCC แนะนำว่า สายพันธุ์ Dehalococcoides และ Clostridiaceae ได้เฉพาะประชากรย่อยในชุมชนนี้ แทน VCC ได้เพิ่มประชากรของสิ่งมีชีวิตในระดับβและγของ Proteobacteria เป็นประชากรที่สำคัญของสิ่งมีชีวิตในคลัสเตอร์ CFB มันเป็นไปได้ว่า symbiotic โต้ตอบเกิดขึ้นระหว่างบางของอนัส phylogenetic กลุ่มภายใต้เงื่อนไขขอ รวมโอน interspecies ไฮโดรเจนจากพันธุ์ Desulfovibrio พันธุ์ Dehalococcoides อย่างไรก็ตาม วิเคราะห์กรดนิวคลีอิกโดยที่ทำที่นี่จะต้องถูกเสริม ด้วยสารเคมีชนิดข้อมูลเพื่อทดสอบสมมุติฐานใด ๆ เกี่ยวกับบทบาทหน้าที่ของสมาชิกในชุมชนต่าง ๆ นอกจากนี้ ผลลัพธ์เหล่านี้แนะนำว่า ชีวิตนอกสกุล Dehalococcoides อาจสามารถ dechlorinating cDCE กับไวนิลคลอไรด์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สมาคมจุลินทรีย์แบบไม่ใช้ออกซิเจน (เรียกว่าอนัส) ที่ reductively dechlorinates trichloroethene (TCE) อย่างสมบูรณ์เพื่อ ethene กับการผลิตชั่วคราวของถูกต้อง-dichloroethene (cDCE) และไวนิลคลอไรด์ผสานจากดินปนเปื้อนได้รับจากการเดินเล่นสถานีทหารเรืออากาศ อนัสใช้นมเป็นอิเล็กตรอนบริจาคและได้รับการทำงานที่มั่นคงมานานกว่า 2 ปี หลังจากการสัมผัสสั้น ๆ กับออกซิเจนวัฒนธรรม (VCC กำหนด) ที่ได้มาจากอนัสอาจ dechlorinate TCE เท่านั้นที่จะไวนิลคลอไรด์ที่มีนมเป็นอิเล็กตรอนบริจาค สามวิธีโมเลกุลถูกนำมาใช้ควบคู่กันไปจะอธิบายลักษณะโครงสร้างชุมชนของอนัสและ VCC: โคลนก่อสร้างห้องสมุด / ลำดับโคลนส่วนข้อ จำกัด แตกต่างขั้วระยะเวลา (T-RFLP) การวิเคราะห์และการเรืองแสงในแหล่งกำเนิดพันธุ์ (FISH) กับยานสำรวจ rRNA โครงสร้างของชุมชนอนัสไม่ได้เปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญในช่วงเวลาของการให้อาหารเดียว / รอบ dechlorination และความผันผวนที่เกิดขึ้นเพียงเล็กน้อยในช่วงหลายรอบให้อาหารทอดหลักสูตร 1 ปี ห้องสมุดโคลนและ T-RFLP วิเคราะห์ชี้ให้เห็นว่าอนัสถูกครอบงำโดยประชากรที่เป็นสามกลุ่ม phylogenetic: ชนิด Dehalococcoides ชนิด Desulfovibrio และสมาชิกของ Clostridiaceae (ภายในต่ำ G + C แกรมบวก) ผลการชี้ให้เห็นว่าปลาสมาชิกของ Cytophaga / Flavobacterium / Bacteroides (CFB) กลุ่มสูง G + C แกรมบวก (HGCs) เป็นตัวเลขที่สำคัญในการ Anas แม้จะมีการแสดงของพวกเขาภายใต้ในห้องสมุดโคลน การวิเคราะห์แบบขนานของกลุ่มตัวอย่าง VCC ชี้ให้เห็นว่าสายพันธุ์ Dehalococcoides Clostridiaceae และมีประชากรเพียงเล็กน้อยในชุมชนแห่งนี้ แต่ VCC ได้เพิ่มประชากรของสิ่งมีชีวิตใน subclasses βและγของ Proteobacteria เช่นเดียวกับประชากรที่สำคัญของสิ่งมีชีวิตในกลุ่ม CFB เป็นไปได้ว่าการมีปฏิสัมพันธ์ทางชีวภาพที่เกิดขึ้นระหว่างกลุ่มบางส่วนของสายวิวัฒนาการของอนัสภายใต้เงื่อนไขการตกแต่งรวมทั้งการถ่ายโอน interspecies ไฮโดรเจนจากสายพันธุ์ Desulfovibrio ชนิด Dehalococcoides อย่างไรก็ตามการวิเคราะห์กรดนิวคลีอิกที่ใช้ดำเนินการที่นี่จะต้องมีการเสริมด้วยสารเคมีชนิดข้อมูลเพื่อทดสอบสมมติฐานใด ๆ เกี่ยวกับบทบาทหน้าที่ของสมาชิกในชุมชนต่างๆ นอกจากนี้ผลลัพธ์เหล่านี้ชี้ให้เห็นว่าสิ่งมีชีวิตนอกประเภท Dehalococcoides อาจจะมีความสามารถในการ dechlorinating cDCE ไวนิลคลอไรด์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีกลุ่มจุลินทรีย์ไร้อากาศ ( เรียกว่า นัส ) ที่ reductively dechlorinates ไตรคลอโร ทีน ( TCE ) สมบูรณ์พรมกับการผลิตชั่วคราวของ dichloroethene CIS ( cdce ) และไวนิลคลอไรด์ถูกอุดมจากดินปนเปื้อนที่ได้รับจากสถานีเรืออากาศอลาเมด้า นัสใช้แลคเป็นอิเล็กตรอนและได้รับการทำงานที่มั่นคงมานานกว่า 2 ปีต่อไปนี้เป็นสรุปเปิดรับออกซิเจน วัฒนธรรมย่อย ( เขต VCC ) ได้มาจากนัสอาจ dechlorinate TCE เพียงไวนิลคลอไรด์กับแลคเป็นอิเล็กตรอน . สามวิธีที่ใช้กัน ในลักษณะของโมเลกุลและโครงสร้างชุมชนของนัส VCC :  ก่อสร้าง / โคลนการโคลนห้องสมุด เทอร์มินัลจำกัด fragment length polymorphism ( t-rflp ) การวิเคราะห์และเรืองแสงใน situ hybridization ( FISH ) กับ rRNA ) . โครงสร้างชุมชนของนัสไม่ได้เปลี่ยนแปลงอย่างมีนัยสำคัญมากกว่าหลักสูตรของรอบการให้ / การบริหารเดียวและความผันผวนเพียงเล็กน้อยเกิดขึ้นมาหลายทอดอาหารรอบหลักสูตร 1 ปีห้องสมุดโคลนและวิเคราะห์ t-rflp ชี้ให้เห็นว่าประชากรของนัสถูกครอบงำโดยสามกลุ่ม :   dehalococcoides ชนิด สูตรต่างๆ ชนิด และสมาชิกของ Clostridiaceae ( ภายในต่ำ G C กรัมบวก )ผลปลาแนะนำว่าสมาชิกของ cytophaga / ฟลาโวแบคทีเรียม / bacteroides ( cfb ) กลุ่มสูง G C กรัมบวก ( hgcs ) คือ ตัวเลขที่สำคัญในนัสแม้จะของพวกเขาภายใต้การเป็นตัวแทนในโคลนห้องสมุด ขนานวิเคราะห์ตัวอย่าง VCC แนะนำว่า dehalococcoides ชนิดและจำนวนประชากร Clostridiaceae เพียงเล็กน้อยในชุมชนนี้ แทนVCC ได้เพิ่มประชากรของสิ่งมีชีวิตในและบีตาγ subclasses ของโพรทีโอแบคทีเรีย รวมทั้งพบประชากรของสิ่งมีชีวิตใน cfb คลัสเตอร์ เป็นไปได้ว่า ปฏิสัมพันธ์ที่เกิดขึ้นระหว่าง symbiotic บางกลุ่ม นัส ซึ่งภายใต้เงื่อนไขเสริม รวมทั้งการถ่ายโอนจากสูตร interspecies ไฮโดรเจนชนิด dehalococcoides ชนิด อย่างไรก็ตามกรดนิวคลีอิกโดยการวิเคราะห์ที่แสดงที่นี่จะต้องเสริมด้วยข้อมูลสารเคมีชนิดเพื่อทดสอบสมมติฐานใด ๆ เกี่ยวกับบทบาทหน้าที่ของสมาชิกในชุมชนต่าง ๆ นอกจากนี้ ผลการวิจัยนี้ชี้ให้เห็นว่าสิ่งมีชีวิตนอก dehalococcoides สกุลอาจจะสามารถ dechlorinating cdce

ไวนิลคลอไรด์