BLASTN with -F F flag and an e-valu

BLASTN with -F F flag and an e-value
threshold of 0.00005 was performed using all reads from each
sample against the universal single copy genes from organisms for
which at least 25 of the 31 gene sequences were available. Only the
best BLAST hit was taken for each read and only if at least 80% of
the read aligned against a bacterial gene with at least 85% identity.
Coverage was measured in RPKM

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไทด์ที่มีธง -FF และ e-ค่า
เกณฑ์ของ 0.00005 ได้รับการดำเนินการโดยใช้ทั้งหมดอ่านจากแต่ละ
ตัวอย่างกับยีนสำเนาเดียวสากลจากสิ่งมีชีวิตเพื่อ
ที่อย่างน้อย 25 ของลำดับยีน 31 มีอยู่ เพียง
ฮิตระเบิดที่ดีที่สุดถูกนำสำหรับแต่ละอ่านและเฉพาะในกรณีที่ไม่น้อยกว่า 80% ของ
การอ่านชิดกับยีนของแบคทีเรียที่มีอย่างน้อย 85% ตัวตน.
ครอบคลุมวัดใน RPKM

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

blastn กับ F - F ธงและประโยชน์ของการใช้เกณฑ์ของ 0.00005

ทั้งหมดอ่านจากแต่ละตัวอย่างกับสากลเดียวคัดลอกยีนจากสิ่งมีชีวิตสำหรับ
ซึ่งอย่างน้อย 25 ของยีน ลำดับ 31 มี . เพียงตีถูกระเบิด
ที่ดีที่สุดสำหรับแต่ละอ่านเท่านั้นและถ้าอย่างน้อย 80% ของ
อ่านชิดกับยีนจากแบคทีเรียอย่างน้อย 85% ของตัวตน เป็นวัดใน rpkm

ครอบคลุม