1.3 Experimental techniques and lim

1.3 Experimental techniques and limitations
During the last decades, several experimental techniques have been developed and
applied to biological systems. These techniques differ in the nature (alive, preserved
or sectioned) and the size of the sample they can be used for, their sensitivity and the
type and resolution of information they can provide. In this section, I will present some
of the most recent and the most significant methods and studies and I will discuss their
limitations.
The location and orientation of a peptide relative to a lipid bilayer as well as lipids
rearrangement in the presence of a peptide are two important structural characteristics
of peptide-membrane interactions. Experimental techniques that have been used
to get structural information include Fourier Transform Infrared Spectroscopy (FTIR)
[21–27], X-ray and Neutron Diffraction methods [28, 29] as well as Nuclear Magnetic
Resonance (NMR) [30–38]. However, the possibilities of using for example X-ray or
neutron diffraction to gain detailed insights into peptide-membrane systems are limited,
since these systems lack long-range crystalline order. NMR and specifically solidstate
NMR has numerous applications in peptide systems over the last years [33–39].
A series of NMR studies by Opella and co-workers has provided important insights in
peptide orientation [40–42]. Atomic Force Microscopy (AFM) has also been used for
the structural characterization of peptide-membrane systems. Ripple phases in lipid
bilayers induced by lipopeptides, destabilization of a bilayer due to fusion peptides,
and restructuring of the membrane in the presence of specific peptides are some of
the examples where AFM has been used to get information about peptide-membrane
interactions [43–45]. On the other hand, however detailed are the structural characteristics
captured by AFM, the method generally does not provide any chemical information
of the system under study. A recent improvement in this area is the use of
functionalized AFM tip [46].
There are also experimental techniques that can be used in order to map the position
of different molecules in a peptide-lipid bilayer system. Imaging Mass Spectrometry
(IMS), like MALDI1
imaging and secondary ion mass spectrometry (SIMS), is one of
the latest techniques to be developed and among the most powerful ones [47–49]. An-
other promising imaging technique is Surface Plasma Resonance (SPR) spectroscopy,
that allows for the real-time observation of peptide binding to phospholipid bilayers
[50, 51] and membrane-mediated cell signalling [52]. Other imaging techniques used
in peptide-lipid studies are Light Scattering Spectroscopy (SLS (static) or DLS (dynamic))
[53], Fluorescence Spectroscopy [54].
Even with this broad arsenal of experimental techniques it is still difficult to obtain
complete and detailed information about the modes of peptide-membrane interactions.
Let us illustrate the challenges in some of the experimental techniques using
an example of a direct relevance to the current study. Bradshaw and co-workers
have performed a series of important experimental studies on the SIV fusion peptide
[29, 55, 56]. In one of them, the authors carried out neutron diffraction measurements
from stacked multilayers of DOPC and determined the location and orientation of
specifically deuterated SIV fusion peptides within the bilayer. The results from this
study showed that there are two different populations of peptides. One major population
close to the bilayer surface, and a smaller population hidden in the hydrophobic
core. Two equally plausible orientations at 55o and 78o with respect to the bilayer
normal, were found consistent with the experimental observations. However, based
on the additional FTIR data from previous studies, the oblique orientation at 55o was
accepted as the most probable one.
This illustration also highlights several issues, characteristic for most of the experimental
techniques. First and foremost, the obtained data corresponds to an equilibrium
average over multiple peptide-membrane configurations (in this specific case, average
over various angle and location distributions). Thus, detailed information about a particular
configuration of interest or the detailed information about dynamics of peptidemembrane
assembly is beyond the scope of this approach. Furthermore, to interpret
the obtained data, a model is required, construction or contemplation of which may
be a challenge in itself. Unambiguous behaviour, quite often, can be derived only using
several complementary experimental techniques (in this case, additional data from
FTIR were required). Finally, although as I have already mentioned, some of the experimental
methods are now able to provide a more detailed and dynamic information, it
is also important to remember that in general experimental studies are expensive and
time consuming.
Thus, we still need a description of peptide-membrane interactions which would consider
behaviour of an individual or several peptide molecules, elucidate the dynamics
of the peptide-membrane assembly process, provide a link between the observed
behaviour and the data measured in experiments and be sufficiently modest in the resources
required to systematically explore a large number of systems. I believe these
issues can be addressed within computer simulations, and specifically molecular dynamics.
I will review recent progress in the area with a focus on peptide-membrane
interactions in the next section

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

1.3 ทดลองเทคนิคและข้อจำกัดในช่วงทศวรรษที่ผ่านมา เทคนิคการทดลองต่าง ๆ ได้รับการพัฒนา และใช้ระบบชีวภาพ เทคนิคเหล่านี้แตกต่างกันในธรรมชาติ (มีชีวิตอยู่ รักษาหรือส่วน ๆ) และขนาดของตัวอย่างที่สามารถใช้สำหรับ ของความไวและชนิดและความละเอียดของข้อมูลที่จะสามารถให้ ในส่วนนี้ ฉันจะนำเสนอบางส่วนล่าสุด และมากที่สุดวิธีที่สำคัญ และการศึกษา และจะหารือของพวกเขาข้อจำกัดใด ๆสถานที่ตั้งและการวางแนวของเพปไทด์สัมพันธ์ bilayer ไขมันรวมทั้งโครงการrearrangement ในต่อหน้าของเพปไทด์มีลักษณะโครงสร้างที่สำคัญสองของเมมเบรนเพปไทด์โต้ตอบ เทคนิคการทดลองที่ใช้รับโครงสร้าง ข้อมูลรวมถึงฟูรีเยแปลงอินฟราเรดก (FTIR)[21-27], วิธีเอ็กซ์เรย์และการเลี้ยวเบนของนิวตรอน [28, 29] เป็นแม่เหล็กนิวเคลียร์การสั่นพ้อง (NMR) [30-38] อย่างไรก็ตาม ไปใช้เช่นรังสีเอกซเรย์ หรือการเลี้ยวเบนของนิวตรอนได้รับรายละเอียดเจาะลึกระบบเมมเบรนเพปไทด์มีจำกัดเนื่องจากระบบเหล่านี้ขาดลำดับพิสัยผลึก NMR และ solidstate โดยเฉพาะNMR มีโปรแกรมประยุกต์จำนวนมากในระบบเพปไทด์ช่วงปี [33-39]ชุดของ NMR ศึกษาโดย Opella และเพื่อนร่วมงานได้ให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญในเพปไทด์แนว [40-42] นอกจากนี้ยังมีการใช้ Microscopy แรงอะตอม (AFM) สำหรับจำแนกโครงสร้างของระบบเมมเบรนเพปไทด์ ระลอกคลื่นระยะในกระบวนเกิดจาก lipopeptides, destabilization bilayer จากเปปไทด์ฟิวชั่น bilayersและปรับโครงสร้างของเมมเบรนในต่อหน้าของเปปไทด์เฉพาะได้แก่ตัวอย่างที่ได้ใช้ AFM เพื่อรับข้อมูลเกี่ยวกับเยื่อเพปไทด์โต้ตอบ [43-45] บนมืออื่น ๆ รายละเอียดอย่างไรก็ตามมีลักษณะโครงสร้างจับ ด้วย AFM วิธีการโดยทั่วไปไม่มีข้อมูลสารเคมีของระบบภายใต้การศึกษา ปรับปรุงล่าสุดในพื้นที่นี้จะใช้functionalized AFM แนะนำ [46]นอกจากนี้ยังมีเทคนิคการทดลองที่สามารถใช้เพื่อทำแม็ปตำแหน่งของโมเลกุลแตกต่างกันในระบบ bilayer เพปไทด์ไขมัน ภาพรเมท(IMS), เช่น MALDI1ถ่ายภาพ และรองไอออนโตรเมทรี (ซิมส์), เป็นหนึ่งเทคนิคล่าสุดเพื่อพัฒนาและใน หมู่คนมีประสิทธิภาพมากที่สุด [47 – 49] การ-อื่น ๆ เทคนิคถ่ายภาพสัญญาคือ กการสั่นพ้องพลาสม่าผิวคอฟฟี่ช็อป (/)ที่ช่วยให้การสังเกตการณ์แบบเรียลไทม์ของเพปไทด์ผูกกับ bilayers ฟอสโฟลิพิด[50, 51] และเซลล์เมมเบรน mediated แดง [52] เทคนิคถ่ายภาพที่ใช้เพปไทด์กระบวนการศึกษามีแสง Scattering ก (SLS (คง) หรือ DLS (ไดนามิก))[53], fluorescence ก [54]แม้อาร์เซนอลนี้กว้างเทคนิคทดลองจะยังยากที่จะได้รับสมบูรณ์ และรายละเอียดข้อมูลเกี่ยวกับวิธีการโต้ตอบที่เมมเบรนเพปไทด์เราแสดงให้เห็นถึงความท้าทายในบางเทคนิคทดลองใช้ตัวอย่างที่เกี่ยวข้องโดยตรงกับการศึกษาปัจจุบัน Bradshaw และเพื่อนร่วมงานทำชุดทดลองศึกษาสำคัญบนเพปไทด์ฟิวชั่น SIV[29, 55, 56] ในหนึ่งของพวกเขา ผู้เขียนดำเนินการวัดการเลี้ยวเบนของนิวตรอนจาก multilayers DOPC ซ้อน และกำหนดตำแหน่งการจัดวางโดยเฉพาะ deuterated SIV ฟิวชั่นเปปไทด์ใน bilayer ผลจากการนี้การศึกษาพบว่า มีประชากรแตกต่างกันสองของเปปไทด์ ประชากรหลักหนึ่งปิดผิว bilayer และประชากรขนาดเล็กซ่อนอยู่ใน hydrophobicหลักการ แนวสองรับมือเท่าที่ 55o 78o กับ bilayerปกติ พบสอดคล้องกับการสังเกตทดลองการ อย่างไรก็ตาม ตามข้อมูล FTIR เพิ่มเติมจากการศึกษาก่อนหน้านี้ มีการวางแนว oblique ที่ 55oยอมรับเป็นหนึ่งน่าเป็นที่สุดภาพนี้ยังเน้นประเด็นต่าง ๆ ลักษณะสำหรับส่วนมากของการทดลองเทคนิคการ แรก และ สำคัญ ข้อมูลได้รับสอดคล้องกับสมดุลการเฉลี่ยผ่านเมมเบรนเพปไทด์โครงแบบที่หลาย (ในบางกรณีนี้ เฉลี่ยกว่าหลายมุมและตำแหน่งที่ตั้งการกระจาย) ดังนั้น รายละเอียดเกี่ยวกับเฉพาะตั้งค่าคอนฟิกของดอกเบี้ยหรือข้อมูลรายละเอียดเกี่ยวกับ dynamics ของ peptidemembraneแอสเซมบลีจะอยู่นอกเหนือขอบเขตของวิธีการนี้ นอกจากนี้ แปลข้อมูลที่ได้รับ รูปแบบจำเป็น ก่อสร้างหรือสะสมที่พฤษภาคมความท้าทายในตัวเองได้ พฤติกรรมชัดเจน บ่อย สามารถได้รับมาใช้หลายเทคนิคทดลองเสริม (ในกรณี เพิ่มเติมข้อมูลจากFTIR ได้ไม่จำเป็น) สุดท้าย ถึงแม้ว่าเป็นฉันได้กล่าวแล้ว ของการทดลองวิธีก็สามารถให้ข้อมูลแบบไดนามิก และรายละเอียดเพิ่มเติม มันยังจำไว้ในการศึกษาทดลองมีราคาแพง และใช้เวลานานดังนั้น เรายังคงต้องการคำอธิบายของการโต้ตอบเมมเบรนเพปไทด์ซึ่งจะพิจารณาพฤติกรรมของบุคคลหรือหลายเพปไทด์โมเลกุล elucidate เปลี่ยนแปลงของกระบวนการเมมเบรนเพปไทด์ประกอบ มีการเชื่อมโยงระหว่างการสังเกตพฤติกรรมและข้อมูลในการทดลอง และเจียมเนื้อเจียมตัวในทรัพยากรเพียงพอต้องเป็นระบบสำรวจระบบเป็นจำนวนมาก ผมเชื่อว่าเหล่านี้สามารถส่งปัญหาคอมพิวเตอร์ และโดยเฉพาะอย่างยิ่งโมเลกุล dynamicsฉันจะตรวจสอบความคืบหน้าล่าสุดในพื้นที่พร้อมเน้นเมมเบรนเพปไทด์โต้ตอบในส่วนต่อไป

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

1.3 เทคนิคการทดลองและข้อ จำกัดในช่วงทศวรรษที่ผ่านมาเทคนิคการทดลองหลายคนได้รับการพัฒนาและนำไปใช้กับระบบชีวภาพ เทคนิคเหล่านี้แตกต่างกันในธรรมชาติ (ชีวิตที่เก็บรักษาไว้หรือแบ่ง) และขนาดของกลุ่มตัวอย่างที่พวกเขาสามารถใช้สำหรับความไวของพวกเขาและประเภทและความละเอียดของข้อมูลที่พวกเขาสามารถให้ ในส่วนนี้ผมจะนำเสนอบางส่วนของล่าสุดและวิธีการที่สำคัญที่สุดและการศึกษาและผมจะหารือของพวกเขาข้อจำกัด . สถานที่ตั้งและการวางแนวของเปปไทด์สัมพันธ์กับไขมัน bilayer เช่นเดียวกับไขมันปรับปรุงใหม่ในการปรากฏตัวของเปปไทด์ที่มีสองลักษณะโครงสร้างที่สำคัญของการมีปฏิสัมพันธ์เปปไทด์เมมเบรน เทคนิคการทดลองที่มีการใช้เพื่อให้ได้ข้อมูลที่มีโครงสร้างรวมถึงการแปลงฟูริเยร์สเปกอินฟราเรด (FTIR) [21-27], X-ray และวิธีการเลี้ยวเบนนิวตรอน [28 29] เช่นเดียวกับแม่เหล็กนิวเคลียร์Resonance (NMR) [30-38] . แต่ความเป็นไปได้ของการใช้ตัวอย่างเช่น X-ray หรือการเลี้ยวเบนนิวตรอนที่จะได้รับข้อมูลเชิงลึกรายละเอียดลงในระบบเปปไทด์เมมเบรนมีจำกัดเนื่องจากระบบเหล่านี้ขาดระยะยาวเพื่อผลึก NMR และโดยเฉพาะ solidstate NMR มีการใช้งานจำนวนมากในระบบเปปไทด์ในช่วงหลายปีที่ผ่านมา [33-39]. ชุดของการศึกษา NMR โดย Opella และเพื่อนร่วมงานได้จัดให้มีข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญในการวางเปปไทด์[40-42] กล้องจุลทรรศน์แรงอะตอม (AFM) นอกจากนี้ยังมีการใช้ลักษณะโครงสร้างของระบบเปปไทด์เมมเบรน ขั้นตอนระลอกในไขมันbilayers เกิดจาก lipopeptides, destabilization ของ bilayer เนื่องจากการเปปไทด์ฟิวชั่นและการปรับโครงสร้างของเมมเบรนในการปรากฏตัวของเปปไทด์ที่เฉพาะเจาะจงคือบางส่วนของตัวอย่างที่AFM ถูกนำมาใช้จะได้รับข้อมูลเกี่ยวกับเปปไทด์เมมเบรนมีปฏิสัมพันธ์[43- 45] ในทางกลับกัน แต่รายละเอียดจะมีลักษณะโครงสร้างจับโดยAFM วิธีการโดยทั่วไปไม่ได้ให้ข้อมูลสารเคมีใด ๆของระบบภายใต้การศึกษา การปรับปรุงล่าสุดในพื้นที่นี้คือการใช้ปลาย AFM ฟังก์ชัน [46]. นอกจากนี้ยังมีเทคนิคการทดลองที่สามารถใช้ในการสั่งซื้อเพื่อทำแผนที่ตำแหน่งของโมเลกุลที่แตกต่างกันในระบบของเปปไทด์ bilayer ไขมัน การถ่ายภาพมวลสาร(IMS) เช่น MALDI1 ถ่ายภาพและการรองไอออนมวลสาร (SIMS) เป็นหนึ่งในเทคนิคใหม่ล่าสุดที่จะพัฒนาและในหมู่คนที่มีประสิทธิภาพมากที่สุด[47-49] An- เทคนิคการถ่ายภาพที่มีแนวโน้มอื่น ๆ ที่เป็นพื้นผิวพลาสม่า Resonance (SPR) สเปกโทรสโก, ที่ช่วยให้การสังเกตเวลาจริงของการเปปไทด์ผูกพันกับ bilayers เรียม[50, 51] และการส่งสัญญาณของเซลล์เมมเบรนสื่อกลาง [52] เทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆ ที่ใช้ในการศึกษาเปปไทด์ไขมันมีแสงกระเจิงสเปก(SLS (คงที่) หรือ DLS (ไดนามิก)) [53], สเปกเรืองแสง [54]. แม้จะมีนี้คลังแสงกว้างของเทคนิคการทดลองก็ยังคงเป็นเรื่องยากที่จะได้รับที่สมบูรณ์และรายละเอียดเกี่ยวกับรูปแบบของการปฏิสัมพันธ์เปปไทด์เมมเบรน. ขอให้เราแสดงให้เห็นถึงความท้าทายในบางส่วนของเทคนิคการทดลองโดยใช้ตัวอย่างของความเกี่ยวข้องโดยตรงกับการศึกษาในปัจจุบัน Bradshaw และเพื่อนร่วมงานได้ดำเนินการชุดของการศึกษาทดลองที่สำคัญในเปปไทด์ฟิวชั่นSIV [29, 55, 56] ในตอนหนึ่งของพวกเขาที่ผู้เขียนดำเนินการตรวจวัดนิวตรอนเลนส์จากหลายชั้นซ้อนกันของ DOPC และกำหนดตำแหน่งและทิศทางของ deuterated เฉพาะ SIV เปปไทด์ฟิวชั่นภายใน bilayer ผลจากการนี้การศึกษาพบว่ามีสองประชากรที่แตกต่างกันของเปปไทด์ ประชากรหนึ่งที่สำคัญใกล้กับพื้นผิว bilayer และประชากรที่มีขนาดเล็กที่ซ่อนอยู่ในน้ำหลัก สองแนวทางที่เป็นไปได้อย่างเท่าเทียมกันที่ 55o และ 78o ที่เกี่ยวกับ bilayer ปกติพบว่ามีความสอดคล้องกับการสังเกตการทดลอง แต่ขึ้นอยู่กับข้อมูลที่ FTIR เพิ่มเติมจากการศึกษาก่อนหน้านี้การวางแนวเอียง 55o ที่ได้รับการยอมรับว่าเป็นหนึ่งที่น่าจะเป็นที่สุด. ภาพประกอบนี้ยังเน้นหลายประเด็นลักษณะส่วนใหญ่ของการทดลองเทคนิค แรกและสำคัญที่สุดของข้อมูลที่ได้สอดคล้องกับความสมดุลเฉลี่ยมากกว่าการกำหนดค่าเปปไทด์หลายเมมเบรน(ในกรณีนี้ค่าเฉลี่ยมากกว่ามุมที่หลากหลายและการกระจายสถานที่) ดังนั้นข้อมูลรายละเอียดเกี่ยวกับโดยเฉพาะอย่างยิ่งการกำหนดค่าของสนใจหรือข้อมูลรายละเอียดเกี่ยวกับการเปลี่ยนแปลงของ peptidemembrane ชุมนุมอยู่นอกเหนือขอบเขตของวิธีการนี้ นอกจากนี้ในการตีความข้อมูลที่ได้รับในรูปแบบที่จำเป็นต้องมีการก่อสร้างหรือการทำสมาธิซึ่งอาจเป็นสิ่งที่ท้าทายในตัวเอง พฤติกรรมที่ชัดเจนค่อนข้างบ่อยจะได้รับเพียงการใช้เทคนิคการทดลองหลายเสริม (ในกรณีนี้ข้อมูลเพิ่มเติมจาก FTIR ถูกต้อง) ในที่สุดแม้ว่าที่ผมได้กล่าวไว้แล้วบางส่วนของการทดลองวิธีการอยู่ในขณะนี้สามารถที่จะให้ข้อมูลรายละเอียดเพิ่มเติมและแบบไดนามิกมันยังเป็นสิ่งสำคัญที่ต้องจำไว้ว่าในการศึกษาทดลองทั่วไปมีราคาแพงและใช้เวลานาน. ดังนั้นเราจึงยังคงต้องอธิบาย ของการมีปฏิสัมพันธ์เปปไทด์เมมเบรนที่จะพิจารณาพฤติกรรมของโมเลกุลของเปปไทด์ของแต่ละบุคคลหรือหลายอธิบายการเปลี่ยนแปลงของกระบวนการผลิตเปปไทด์เมมเบรนให้การเชื่อมโยงระหว่างสังเกตพฤติกรรมและข้อมูลที่วัดในการทดลองและมีความเพียงพอที่เจียมเนื้อเจียมตัวในทรัพยากรที่จำเป็นในการระบบสำรวจจำนวนมากของระบบ ผมเชื่อว่าเหล่านี้ปัญหาได้รับการแก้ไขภายในแบบจำลองคอมพิวเตอร์และการเปลี่ยนแปลงโมเลกุลเฉพาะ. ฉันจะตรวจสอบความคืบหน้าล่าสุดในพื้นที่ที่มีความสำคัญกับการเปปไทด์เมมเบรนมีปฏิสัมพันธ์ในส่วนถัดไป

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

1.3 เทคนิคการทดลองและข้อ
ในระหว่างทศวรรษสุดท้าย เทคนิคการทดลองต่าง ๆได้มีการพัฒนาและประยุกต์ระบบชีวภาพ
. เทคนิคเหล่านี้แตกต่างกันในธรรมชาติ ( ชีวิตรักษา
หรือตัด ) และขนาดของตัวอย่างที่พวกเขาสามารถใช้สำหรับประเภทของความไวและความละเอียดของข้อมูล
และพวกเขาสามารถให้ ในส่วนนี้ผมจะนำเสนอบาง
ของล่าสุดและวิธีการที่สำคัญที่สุดและการศึกษาและผมจะกล่าวถึงข้อจำกัด
.
ที่ตั้งและทิศทางของเปปไทด์เทียบกับ bilayer ไขมันเป็นไขมัน
ใหม่ในสถานะของเปปไทด์เป็นสำคัญสองลักษณะโครงสร้างของเปปไทด์
เยื่อการโต้ตอบ เทคนิคการทดลองที่ได้รับใช้
เพื่อให้ได้ข้อมูลเชิงโครงสร้าง ได้แก่ การแปลงฟูรีเยอินฟราเรดสเปกโทรสโกปี ( FTIR )
[ 21 ] 27 – รังสีเอกซ์การเลี้ยวเบนนิวตรอนและวิธีการ [ 28 , 29 ] รวมทั้งนิวเคลียร์แมกเนติกเรโซแนนซ์ ( NMR )
[ 30 - 38 ] อย่างไรก็ตาม ความเป็นไปได้ในการใช้ เช่น เอกซเรย์ หรือ
การเลี้ยวเบนนิวตรอนได้รับข้อมูลเชิงลึกที่รายละเอียดในระบบเมมเบรนเปปไทด์เป็น Limited
เนื่องจากระบบเหล่านี้ขาดระยะยาว ( คำสั่งโดยเฉพาะคุณโซลิดสเตท
หลายโปรแกรมในระบบเปปไทด์ปีสุดท้าย [ 33 - 39 ] .
ชุดของ NMR ศึกษาโดย opella และเพื่อนร่วมงานได้ให้ข้อมูลเชิงลึกที่สำคัญ
เปปไทด์ปฐมนิเทศ [ 40 ( 42 ) กล้องจุลทรรศน์แรงอะตอม ( AFM ) ยังถูกใช้สำหรับ
ลักษณะโครงสร้างของระบบเยื่อ เปปไทด์ . ไขมันกระเพื่อม ขั้นตอนในการ lipopeptides
สองชั้น ,destabilization ของสองชั้นจากฟิวชั่นดู
และการปรับโครงสร้างของเยื่อในการแสดงตนของเฉพาะเปปไทด์คือบางส่วนของตัวอย่างที่
AFM ได้ถูกใช้เพื่อให้ได้ข้อมูลเกี่ยวกับเปปไทด์เยื่อ
ปฏิสัมพันธ์ [ 43 - 45 ] บนมืออื่น ๆ รายละเอียด แต่เป็นลักษณะโครงสร้าง
จับโดย AFM , วิธีการโดยทั่วไปไม่ได้ให้ข้อมูลสารเคมี
ของระบบที่ศึกษา การปรับปรุงล่าสุดในพื้นที่นี้คือการใช้ AFM ที่มีปลาย [ 46 ]
.
ยังมีเทคนิคการทดลองที่สามารถใช้เพื่อให้แผนที่ตำแหน่งของโมเลกุลเปปไทด์
แตกต่างกันใน bilayer ไขมันระบบ ภาพมวลสาร
( IMS ) , เช่น ภาพและ maldi1
รองไอออนมวลสาร ( ซิมส์ ) เป็นหนึ่งของ
เทคนิคใหม่ล่าสุดที่จะพัฒนาและในหมู่ที่มีประสิทธิภาพที่สุดที่ 47 ) [ 49 ] -
คนอื่นสัญญาภาพเทคนิคพื้นผิวพลาสม่าเรโซแนนซ์ ( SPR ) spectroscopy ,
ที่ช่วยให้แบบเรียลไทม์ของเปปไทด์แสดงฟอสโฟลิพิดผักหนอง
[ 50 , 51 ) ] และเยื่อเซลล์ส่งสัญญาณ [ 52 ] เทคนิคการถ่ายภาพอื่น ๆที่ใช้
ดไขมันในการศึกษาการกระจายแสงสเปกโทรสโกปี ( SLS ( คงที่ ) หรือ dls ( แบบไดนามิก )
[ 53 ] , fluorescence spectroscopy [ 54 ] .
แม้แต่กับอาร์เซนอลนี้กว้างของเทคนิคการทดลองมันเป็นยังยากที่จะได้รับ
ที่สมบูรณ์และข้อมูลรายละเอียดเกี่ยวกับรูปแบบของเปปไทด์เยื่อปฏิสัมพันธ์ .
ให้เราแสดงให้เห็นถึงความท้าทาย ในบางส่วนของเทคนิคการทดลองใช้
ตัวอย่างของความเกี่ยวข้องโดยตรงต่อการศึกษาในปัจจุบัน แบรดชอว์และเพื่อนร่วมงาน
แสดงชุดของการศึกษาที่สำคัญในการหลอม SIV เปปไทด์
[ 29 , 55 , 56 ) ในหนึ่งของพวกเขา ผู้เขียนนำการเลี้ยวเบนนิวตรอนการวัด
จากซ้อน multilayers ของ dopc และกำหนดตำแหน่งและทิศทางของ
โดยเฉพาะ deuterated SIV เปปไทด์ฟิวชั่นภายในสองชั้น .ผลจากการศึกษานี้พบว่ามีประชากร
สองแตกต่างกันของเปปไทด์ หนึ่งที่สำคัญของประชากร
ใกล้กับพื้นผิวสองชั้น และมีประชากรแฝงในแกน )

สองทิศทางที่เป็นไปได้อย่างเท่าเทียมกันและเคารพ 55o 78o สองชั้น
ปกติ พบว่าสอดคล้องกับการสังเกตทดลอง อย่างไรก็ตาม จาก
บนเพิ่มเติม ( ข้อมูลจากการศึกษาก่อนหน้านี้แนวเฉียงที่ 55o คือ
ยอมรับเป็นน่าจะเป็นหนึ่ง .
ภาพนี้ยังเน้นหลายประเด็น ลักษณะส่วนใหญ่ของเทคนิคการทดลอง

แรกและสำคัญที่สุด ข้อมูลที่สอดคล้องกับค่าเฉลี่ยสมดุล
หลายเปปไทด์แบบเมมเบรน ( ในกรณีนี้โดยเฉพาะ
ผ่านมุมต่าง ๆและการกระจายที่ตั้ง ) ดังนั้น ข้อมูลรายละเอียดเกี่ยวกับโดยเฉพาะ
ค่าดอกเบี้ยหรือรายละเอียดเกี่ยวกับพลวัตของการประกอบ peptidemembrane
อยู่นอกเหนือขอบเขตของวิธีการนี้ นอกจากนี้ การตีความ
ข้อมูล รูปแบบจะต้องก่อสร้างหรือฌานซึ่งอาจ
เป็นความท้าทายในตัวเอง พฤติกรรมชัดเจน ค่อนข้างบ่อยได้มาใช้แค่
หลายเทคนิคการทดลองประกอบ ( ในกรณีนี้ ข้อมูลเพิ่มเติมจาก
( ถูกต้อง ) ในที่สุด แม้ว่าผมได้กล่าวถึงบางส่วนของวิธีการทดลอง
ตอนนี้สามารถให้รายละเอียดเพิ่มเติมและข้อมูลแบบไดนามิก มัน
ยังเป็นสิ่งสำคัญที่ต้องจำไว้ว่าในการศึกษาทดลองทั่วไปมีราคาแพงและ

ดังนั้นเวลานานเรายังต้องการรายละเอียดของเปปไทด์เยื่อปฏิสัมพันธ์ซึ่งจะพิจารณาพฤติกรรมของบุคคลหรือหลาย

เปปไทด์โมเลกุล ทำให้พลวัตของเปปไทด์เยื่อกระบวนการประกอบให้การเชื่อมโยงระหว่างสังเกตพฤติกรรมและข้อมูล
วัดในการทดลองและเจียมเนื้อเจียมตัวอย่างเพียงพอในแหล่ง
ต้องมีระบบสํารวจจํานวนของระบบ .ผมเชื่อว่าปัญหาเหล่านี้
สามารถให้ความสนใจภายในคอมพิวเตอร์จำลองและโดยเฉพาะที่พลศาสตร์โมเลกุล .
ผมจะทบทวนความคืบหน้าล่าสุดในพื้นที่ โดยมุ่งเน้นเปปไทด์เยื่อ
การโต้ตอบในส่วนถัดไป