Peak lists (MGF) were created in Ma

Peak lists (MGF) were created in Mass Matrix Mass Spectrometric File Conversion Tools version 3.2. Peak lists were searched against Swiss–Prot and a decoy database using Mascot 2.3 . The following parameters were set for each search: tax- onomy was set to Homo sapiens; enzyme = trypsin; up to 3 missed cleavages; variable modifications: carbamidomethyl (C), deamidation (NQ), carboxy (E), oxidation (MKP); static modifications: none; peptide tolerance = 10 ppm; fragment tolerance = 0.5 Da; and pep- tide charge = 2+, 3+, 4+. Peptide results were filtered using Percolator at P < 0.05. Peptides with nonsensical post-translational modifications (e.g., carboxyglutamic acid [Gla] on non-Gla-containing proteins) were filtered by hand.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

รายการสูงสุด (MGF) สร้างขึ้นในมวลเมตริกซ์มวล Spectrometric แฟ้มเครื่องมือการแปลงรุ่น 3.2 รายการสูงสุดได้ค้นหาจากสวิส-Prot และฐานข้อมูลลวงที่ใช้ 2.3 แมสคอท พารามิเตอร์ต่อไปนี้ถูกกำหนดสำหรับแต่ละการค้นหา: ภาษี onomy ถูกตั้งค่าให้ตุ๊ด sapiens เอนไซม์ทริปซิน = cleavages พลาด 3 ตัวแปร modifications: carbamidomethyl (C), deamidation (NQ), carboxy (E), ออกซิเดชัน (MKP); คง modifications: ไม่มี ยอมรับเพปไทด์ = 10 ppm แยกส่วนยอมรับ = 0.5 ดา และ pep-ไทด์ค่าธรรมเนียม = 2 + 3 + 4 + เพปไทด์ก็ใช้ Percolator ที่ P filtered < 0.05 เปปไทด์กับ modifications post-translational nonsensical (เช่น carboxyglutamic กรด [จีแอลเอ] ในไม่-จีแอลเอประกอบด้วยโปรตีน) มี filtered ด้วยมือ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รายการยอด (MGF) ถูกสร้างขึ้นในมวล Matrix มวล Spectrometric เครื่องมือการแปลงแฟ้มรุ่น 3.2 รายการยอดถูกค้นกับสวิส Prot และฐานข้อมูลที่ใช้ล่อมิ่งขวัญ 2.3 พารามิเตอร์ต่อไปนี้ได้รับการตั้งค่าสำหรับการค้นหาแต่ละ: onomy ภาษีเงินได้ถูกกำหนดให้มนุษย์ปัจจุบัน; เอนไซม์ trypsin =; ได้ถึง 3 ปริพลาด; ไพเพอ Modi Fi ตัวแปร: carbamidomethyl (C), deamidation (NQ), Carboxy (E), ออกซิเดชัน (MKP); ไพเพอ Fi Modi แบบคงที่: none; ความอดทนเปปไทด์ = 10 ppm; ความอดทนส่วน = 0.5 ดา; และค่าใช้จ่ายน้ำ pep- = 2+, 3+, 4 + ผลเปปไทด์ที่ถูกไฟ ltered ใช้กรอง P <0.05 เปปไทด์ที่มีประจุบวก Fi Modi โพสต์แปลไร้สาระ (เช่นกรด carboxyglutamic [Gla] ในที่ไม่ Gla ที่มีโปรตีน) ถูกไฟ ltered ด้วยมือ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

รายการยอด ( MGF ) ถูกสร้างขึ้นในมวลมวลความเมทริกซ์การแปลงไฟล์เครื่องมือรุ่น 3.2 . รายการยอดถูกตรวจค้นกับสวิส–ก่อนและต่อฐานข้อมูลโดยใช้มาสคอต 2.3 พารามิเตอร์ต่อไปนี้ถูกตั้งค่าแต่ละค้นหา : ภาษี - onomy ถูกตั้งค่าให้โฮโมซาเปียน เอนไซม์ทริปซิน = ; ถึง 3 พลาดจึงทำให้รอยร้าว ตัวแปรโมดิ : carbamidomethyl ( C ) , ดีแอมมิ เดชัน ( NQ ) , คาร์บ๊อกซี่ ( E )ออกซิเดชัน ( MKP ) ; คงที่จึงทำให้โมดี : none ; เปปไทด์ความอดทน = 10 ppm ; มีความอดทน = 0.5 ดา และเป๊ปไทด์ - ค่าใช้จ่าย = 2 , 3 , 4 ผลการ ltered เปปไทด์ถูกจึงกรองที่ p < 0.05 เปปไทด์กับตนจึงทำให้ไปรษณีย์ - แปล Modi ( เช่นกรด GLA carboxyglutamic [ ] ไม่กล้าประกอบด้วยโปรตีน ) จึง ltered ด้วยมือ