As stated by the manufacturer, the

As stated by the manufacturer, the cartridge removes over 95% of detergents. From Fig. 2, when applied to intact proteins, SDS depletion approached the 99% removal threshold – well above the manufacturer specifications, though still less than other deple- tion protocols. A lower level of residual SDS observed for the
0.1 g/L E. coli protein test solution may be attributed to the high variance in the Of the eight methods assessed, the highest detergent removal efficiency was observed with FASP II (30 kDa membranes). From Fig. 2, with all four test solutions, FASP II consistently depleted SDS to levels below the limit of quantitation of our LC–MS/MS assay. This corresponds to well over 99.99% SDS depletion. Using 10 kDa filters, the residual SDS was slightly higher (between 3 and 4 g), though still among the better performing SDS depletion protocols, and well below the 10 g cutoff permitting LC–MS analysis. Wis- niewski has previously shown that larger MWCO filters are more efficient at SDS depletion [28]. An exceptional level of SDS depletion was also observed through in-gel digestion of the BSA test sam- ples, though detectable levels of SDS were observed with the E. coli
test samples. With E. coli, a larger (∼1 cm) gel band was excised
to recover the full E. coli proteome from the gel. We also note the
shorter resolving period, which may not be sufficient to isolate the higher concentration of SDS from the sample loading buffer. It can therefore be stated that FASP II is as effective as a conventional in-gel digestion protocol in terms of SDS depletion

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตามที่ระบุ โดยผู้ผลิต ตลับหมึกเอากว่า 95% ของผงซักฟอก จากรูป 2 เมื่อใช้กับโปรตีนเหมือนเดิม SDS เชิงทาบทาม 99% เอาเกณฑ์ที่สูงกว่าผู้ผลิตข้อมูล แต่ยังน้อยกว่า deple-ทางการค้าโพรโทคอลอื่น ๆ สังเกตของ SDS ที่เหลือสำหรับการ0.1 แยกไลโปรตีนทดสอบแก้ปัญหาอาจเป็นเพราะผลต่างของแปดวิธีประเมินที่สูง สังเกต efficiency ซักฟอกกำจัดสูงสุด ด้วย FASP II (เยื่อหุ้ม 30 kDa) จากรูป 2 ด้วยโซลูชันทั้งหมดในการทดสอบสี่ FASP II สม่ำเสมอหมด SDS ไประดับต่ำกว่าขีดจำกัดของการวิเคราะห์หาปริมาณวิเคราะห์ LC – MS/MS ของเรา นี้สอดคล้องกับดีกว่า 99.99% SDS เชิง ใช้ฟิลเตอร์ kDa 10, SDS เหลือคือสูงขึ้นเล็กน้อย (ระหว่าง 3 และ 4 g), แต่ยังคงในหมู่ประสิทธิภาพดีกว่าโปรโตคอเชิง SDS และดีด้านล่าง 10 กรัมตัด permitting LC – MS วิเคราะห์ Wis niewski ก่อนหน้านี้ได้แสดงว่า ฟิลเตอร์ MWCO ใหญ่มีประสิทธิผลมากกว่าที่ SDS ลดลง [28] ข้อความของ SDS เชิงถูกยังตรวจสอบผ่านการย่อยในเจบีเอสเอการทดสอบสาม-ples ว่าตรวจระดับของ SDS ได้ตรวจสอบกับการไลตัวอย่างทดสอบ มีไล วงเจ (∼1 cm) ขนาดใหญ่ถูกสรรพสามิตการกู้คืน proteome ไลเต็มจากเจ เราทราบลดแยกระยะ ซึ่งอาจเป็น sufficient เพื่อแยกความเข้มข้นสูงของ SDS จากบัฟเฟอร์โหลดตัวอย่าง มันสามารถระบุดังนั้นการ FASP II ใช้โพรโทคอการย่อยอาหารในเจธรรมดาในแง่ของการลดลงของ SDS

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ตามที่ระบุไว้โดยผู้ผลิตตลับหมึกลบกว่า 95% ของผงซักฟอก จากรูป 2 เมื่อนำไปใช้โปรตีนเหมือนเดิมพร่อง SDS เข้าหาเกณฑ์การกำจัด 99% - ดีกว่าไพเพอร์ระบุไว้ผู้ผลิตแม้ว่าจะยังคงน้อยกว่าโปรโตคอลการ deple- อื่น ๆ ระดับที่ต่ำกว่าของที่เหลือ SDS สังเกตสำหรับ
0.1 กรัม / ลิตรอีสารละลายทดสอบโปรตีน coli อาจนำมาประกอบกับความแปรปรวนสูงในของแปดวิธีการประเมินการกำจัดผงซักฟอกสูงสุดประสิทธิภาพการสายพบว่ามี FASP ครั้งที่สอง (30 กิโลดาลตันเยื่อ) จากรูป 2 กับทั้งสี่โซลูชั่นการทดสอบครั้งที่สอง FASP หมดลงอย่างต่อเนื่องที่จะ SDS ระดับที่ต่ำกว่าขีด จำกัด ของปริมาณการทดสอบ LC-MS / MS ของเรา นี้สอดคล้องกับดีกว่า 99.99% การสูญเสีย SDS การใช้ไฟ 10 กิโลดาลตันกรองการที่เหลือ SDS เล็กน้อยที่สูงขึ้น (ระหว่าง 3 และ 4 กรัม) แต่ยังคงเป็นหนึ่งที่ดีกว่าโปรโตคอลพร่อง SDS ประสิทธิภาพและต่ำกว่า 10 กรัมตัดอนุญาตให้วิเคราะห์ LC-MS Wis- niewski ได้แสดงให้เห็นก่อนหน้านี้ว่ามีขนาดใหญ่ไฟกรองการ MWCO มีเพียงพอไฟ EF เพิ่มเติมได้ที่สูญเสีย SDS [28] ในระดับที่โดดพร่อง SDS พบว่ายังผ่านการย่อยอาหารในเจลของการทดสอบ BSA sam- Ples แต่ตรวจพบระดับของ SDS พบกับเชื้อ E. coli
ตัวอย่างทดสอบ ด้วยเชื้อ E. coli, ที่มีขนาดใหญ่ (~1 เซนติเมตร)
วงเจลถูกพอที่จะกู้คืนเต็มE. coli โปรตีนจากเจล นอกจากนี้เรายังทราบระยะเวลาการแก้ไขปัญหาที่สั้นลงซึ่งอาจจะไม่เพียงพอ Suf สายที่จะแยกความเข้มข้นที่สูงขึ้นของ SDS จากบัฟเฟอร์โหลดตัวอย่าง
ดังนั้นจึงอาจกล่าวได้ว่าเป็นครั้งที่สอง FASP เป็นผลเป็นธรรมดาในเจลโปรโตคอลการย่อยอาหารในแง่ของการสูญเสีย SDS

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ตามที่ระบุโดยผู้ผลิตตลับหมึกเอากว่า 95% ของผงซักฟอก จากรูปที่ 2 เมื่อใช้กับโปรตีนครบถ้วน SDS ตัวเข้าหา 99% เอาเกณฑ์–เหนือผู้ผลิตกาจึง ทำให้ถึงแม้จะยังไม่ถึง deple - อื่นๆผ่านโปรโตคอล ระดับลดลงเหลือ 0.1 สังเกตสำหรับ0.1 g / L E . coli โปรตีนทดสอบโซลูชั่นที่อาจจะเกิดจากความแปรปรวนสูงในของแปดวิธีการประเมิน ประสิทธิภาพสูงสุดในการกำจัดผงซักฟอก EF จึงพบว่า มี fasp II ( 30 kDa membranes ) จากรูปที่ 2 มีทั้งหมดสี่โซลูชั่นทดสอบ fasp II อย่างต่อเนื่องหมด SDS ระดับด้านล่างขีด จำกัด ของเซลล์ของ LC MS / MS และการทดสอบ ตรงนี้ได้ดีกว่า 99.99% SDS การพร่อง . ใช้ 10 กิโลดาลตันจึง lters , ตกค้าง SDS คือสูงกว่าเล็กน้อย ( ระหว่าง 3 และ 4 G ) แต่ยังคงประสิทธิภาพที่ดีขึ้นของ SDS ของโปรโตคอลและด้านล่างตัว 10 กรัม และอนุญาตให้ LC MS การวิเคราะห์ WIS - niewski ก่อนหน้านี้ได้แสดงให้เห็นว่า mwco ขนาดใหญ่จึงมีมากขึ้น lters EF จึง cient ที่ SDS พร่อง [ 28 ] พิเศษระดับของ SDS ตัวพบว่าเจลผ่านในการย่อยอาหารของ BSA ทดสอบแซม - ples แม้ว่าการตรวจพบระดับของ SDS พบกับ E . coliตัวอย่างทดสอบ กับ E . coli , ขนาดใหญ่ ( ∼ 1 ซม. ) เจลถูกตัดวงกู้คืนโปรตีโอม E . coli เต็มจากเจล เรายังทราบการแก้ไขในระยะสั้น ซึ่งอาจจะ cient ซุฟจึงแยกความเข้มข้นของ SDS จากตัวอย่างโหลดบัฟเฟอร์ มันจึงสามารถระบุว่า fasp II เป็นที่มีประสิทธิภาพเป็นปกติในขั้นตอนการย่อยอาหาร เจล ในแง่ของ SDS การพร่อง