ในการเดินทางไปเมืองนารา ประเทศญี่ปุ่นในครั้งนี้นั้น มีจุดประสงค์เพื่อการนำเสนอโครงงานวิทยาศาสตร์ และแลกเปลี่ยนความรู้ทางวัฒนธรรมกับ Nara Prefectural Seisho High School โดยความร่วมมือกับโครงการซากุระ ซึ่งสามารถสรุปการทำกิจกรรมได้ ดังนี้
คณะบุคคลากรจากโรงเรียนจุฬาภรณราชวิทยาลัย นครศรีธรรมราช(โรงเรียนวิทยาศาสตร์ภูมิภาค) ประกอบด้วย อาจารย์ผู้ควบคุม และนักเรียนรวมทั้งสิ้นแล้ว 11 คน ได้เดินทางไปถึงยังท่าอากาศยานนานาชาติคันไซ เมืองโอซากา ประเทศญี่ปุ่น วันที่ 10 กุมภาพันธ์ 2559 ในเวลาประมาณ 06.30 น. โดยมีบุคลากรจาก Nara Prefectural Seisho High School คือ อาจารย์ประจำวิชาภาษาอังกฤษให้การต้อนรับอย่างอบอุ่น ทางคณะบุคคลกรเดินทางออกจากท่าอากาศยานนานาชาติคันไซไปยัง Kyoto University’s Museum ในเวลาประมาณ 09.30 น. เพื่อศึกษางานค้นคว้าและการค้นพบในส่วนของวิทยาศาสตร์และประวัติศาสตร์ที่ถูกค้นพบโดยมหาวิทยาลัยเกียวโต ในพิพิธภัณฑ์ได้แบ่งการจัดแสดงเป็นสองส่วนด้วยกัน ส่วนแรกคือส่วนของวิทยาศาสตร์ ซึ่งจะได้แสดงเกี่ยวกับซากฟอสซิลของสัตว์และงานค้นคว้าอื่นๆที่ค้นพบในเมืองเกียวโต ส่วนที่สองคือส่วนของประวัติศาสตร์ ที่จัดแสดงชิ้นส่วนต่างๆที่ถูกขุดพบโดยคณะบุคลากรของมหาวิทยาลัย แสดงให้เห็นถึงประวัติศาสตร์อันยาวนานของเมืองเกียวโต เวลาประมาณ 13.00 น. ทางคณะบุคลากรของโรงเรียนจุฬาภรณราชวิทยาลัย นครศรีธรรมราช ได้เข้าฟังบรรยายพิเศษจากคณะอาจารย์จากทางมหาวิทยาลัยเกียวโต ในหัวข้องานศึกษาค้นคว้าของมหาวิทยาลัย ซึ่งเกี่ยวกับแบคทีเรีย พร้อมทั้งได้เยี่ยมชมการปฏิบัติงานในห้องปฏิบัติการของทางมหาวิทยาลัย หลังจากนั้นได้เดินทางออกจากมหาวิทยาลัยเกียวโตในเวลาประมาณ 14.30 น. และเดินทางถึง kiyomizu temple ในเวลาประมาณ 15.30 น. เพื่อรับชมวิถีชีวิตและสถานที่สำคัญของเกียวโต ซึ่งคนญี่ปุ่นนั้นมีความเชื่อว่า การล้างมือด้วยน้ำจากวัดจะช่วยชำระล้างสิ่งสกปรกออกไปได้ เวลาประมาณ 17.00 น. เพื่อเดินทางเข้าที่พักและรับประทานอาหารเย็น
ในวันที่ 11 กุมภาพันธ์ 2559 คณะบุคคลากรจากโรงเรียนจุฬาภรณราชวิทยาลัย นครศรีธรรมราชได้เดินทางออกจากโรงแรม kutsuraki และเดินทางถึง Nara Prefectural Seisho High School และเข้าร่วมพิธีต้อนรับที่จัดขึ้นโดยคณะผู้บริหารและคณะอาจารย์ รวมไปจนถึงนักเรียนจากโครงการ Thailand-Japan Science Student Science Fair 2015 ในเวลาประมาณ 09.00 น. และเข้าร่วมในการเรียนการสอนของทางโรงเรียนในรายวิชาชีววิทยา คณิตศาสตร์ และในวิชาอังกฤษ ทางคณะบุคคลากรได้เข้าร่วมการสอนเพื่อเผยแพร่วัฒนธรรมไทยอีกด้วย หลังจากการรับประทานอาหารเที่ยง ทางโรงเรียนได้จัดการแสดงทางวิทยาศาสตร์เพื่อต้อนรับคณะบุคคลการจากไทยเป็นพิเศษ ในเวลาประมาณ 13.00 น. ได้จัดแบ่งกลุ่มคณะบุคคลากรออกเป็นสองกลุ่ม กลุ่มแรกเพื่อศึกษาโครงงานของนักเรียนเกรดสิบเอ็ด และกลุ่มที่สองเพื่อศึกษาเครื่องร่อนกระดาษจากนักเรียนเกรดสิบเอ็ดเช่นกัน เวลาประมาณ 15.30 น. คณะนักเรียนจากไทยได้เข้าร่วมการฝึกยิงธนูจากอาจารย์และนักเรียนเกรดสิบสอง ซึ่งธนูนับเป็นกีฬาที่มีมาตั้งแต่โบราณของประเทศญี่ปุ่น และเดินทางกลับโรงแรม kutsuraki ในเวลาประมาณ 17.00 น. และรับประทานอาหารเย็น
ในวันที่ 12 กุมภาพันธ์ 2559 คณะบุคลากรจากไทยเดินทางไปยังโรงงานทากาโทริ ในเวลา 08.00 น. ซึ่งโรงงานทากาโทรินั้นเป็นโรงงานที่จัดตั้งมายาวนาน โรงงานทากาโทรินั้นเป็นโรงงานที่มีไว้เพื่อผลิตเครื่องจักรและอุปกรณ์ที่ใช้ผลิตหน้าจอโทรศัพท์ เครื่องตัดบางต่างๆ และโรงงานทากาโทริยังมีการผลิตหลอดแอลอีดีอีกด้วย ซึ่งโรงงานหลายๆโรงงานในไทยก็มีการสั่งซื้อเครื่องจักรจากโรงงงานทากาโทรินี้เช่นกัน ในเวลา 10.30 น. ได้เดินทางออกจากโรงงานทากาโทริเพื่อไปรับนักเรียนจากโครงการ Thailand-Japan Science Student Science Fair 2015 ที่โรงเรียน Nara Prefectural Seisho High School และเดินทางไปยังโรงงานทามูระ เพื่อรับประทานอาหารเที่ยงที่ทางโรงงานจัดให้ ในเวลาประมาณ 13.30 น. ทางโรงงานทามูระได้พาเดินชมสวนสมุนไพรที่เป็นวัตถุดิบของทางโรงงาน สมุนไพรส่วนใหญ่นั้นเป็นสมุนไพรที่เป็นสมุนไพรจีน และสมุนไพรท้องถิ่นของญี่ปุ่น ทางโรงงานพาคณะบุคคลากรไปเดินชมโรงงานซึ่งเป็นโรงงานผลิตยา เป็นที่หน้าเสียดายที่ทางคณะไม่สามารถเข้าชมได้ตลอดทั้งหมด เนื่องจากเป็นวันปิดของโรงงาน ทางคณะบุคลากรเดินทางกลับไปยังโรงแรมในเวลา 17.00 น. และรับประทานอาหารเย็น