MEASURING THE EPIGENOMEClearly, cha

MEASURING THE EPIGENOME
Clearly, changes to the epigenome play a fundamental role in the development, baseline regulation, and experience-
dependent alteration of the nervous system as a whole. However, this invites another question: How can we begin
to understand which epigenetic modifications are important and which modifications we would seek to manipulate
as part of a pharmacoepigenomic strategy? In essence, the answer to this question lies in our ability to link specific
epigenetic modifications to discrete transcriptional outcomes, as defined in the section titled Druggable Epigenome.
Single-nucleotide resolution: The language of the DNA methylome is dominated by modifications that oc-
cur at single cytosine nucleotides. Therefore, it is necessary to measure epigenetic changes with techniques that
capture this resolution. Scientists investigating the epigenome have long used bisulfite sequencing to investigate
modifications at individual cytosine bases in DNA. This approach has proved to be useful for interrogating the
methylation status of individual cytosine bases in DNA (32, 34, 36). Although bisulfite sequencing was once limited
by the fact that both mC and hmC are preserved during bisulfite treatment (44), recent methodologies have built
upon this approach to enable separate hydroxymethylation and methylation characterization (45, 46). A second,
largely complementary method for estimation of global DNA methylation or hydroxymethylation involves high-
performance liquid chromatography in tandem with mass spectrometry, which allows quantitative measurement of
each modification in comparison to total cytosine (41, 47). However, this technique is limited by its inability to map
cytosine modifications to any specific genomic locus.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วัด epigenome
เห็นได้ชัดว่าการเปลี่ยนแปลง epigenome มีบทบาทพื้นฐานในการพัฒนากฎระเบียบพื้นฐานและ experience-
การเปลี่ยนแปลงขึ้นอยู่กับระบบประสาทรวม แต่นี้ขอเชิญทุกคำถามอื่น:
วิธีที่เราสามารถเริ่มต้นที่จะเข้าใจซึ่งepigenetic ไพเพอร์ Modi ไฟที่มีความสำคัญและที่ไพเพอร์ Modi
ไฟเราจะพยายามที่จะจัดการกับเป็นส่วนหนึ่งของกลยุทธ์pharmacoepigenomic? ในสาระสำคัญคำตอบสำหรับคำถามนี้อยู่ในความสามารถของเราที่จะเชื่อมโยง speci สายค
epigenetic ไพเพอร์ Modi ไฟที่จะไม่ต่อเนื่องผลการถอดรหัสเป็นนิยามในหัวข้อ Druggable epigenome.
ความละเอียดเดียวเบื่อหน่าย: ภาษาของ methylome ดีเอ็นเอที่ถูกครอบงำด้วยไพเพอร์ Modi ไฟที่ oc-
เลว ที่นิวคลีโอ cytosine เดียว ดังนั้นจึงเป็นสิ่งที่จำเป็นในการวัดการเปลี่ยนแปลง epigenetic
กับเทคนิคที่จับภาพการแก้ปัญหานี้ นักวิทยาศาสตร์ตรวจสอบ epigenome มีสาย bisul
ใช้งานมานานลำดับเต้ที่จะตรวจสอบไพเพอร์ไฟModi ที่ฐาน cytosine ในแต่ละดีเอ็นเอ วิธีการนี้ได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์ในการสอบสวนสถานะ methylation ฐาน cytosine ในแต่ละดีเอ็นเอ (32, 34, 36)
แม้ว่าสาย bisul ลำดับเต้ จำกัด
ครั้งเดียวจากข้อเท็จจริงที่ว่าทั้งสองพิธีกรHMC จะถูกเก็บไว้ในช่วงสาย bisul รักษาเต้ (ที่ 44)
วิธีการที่ผ่านมาได้สร้างขึ้นเมื่อวิธีการนี้เพื่อเปิดใช้hydroxymethylation แยกต่างหากและลักษณะ methylation (45, 46) เป็นครั้งที่สอง,
วิธีการเสริมส่วนใหญ่ประมาณดีเอ็นเอ methylation ทั่วโลกหรือเกี่ยวข้องกับการ hydroxymethylation
สูงของเหลวchromatography
ประสิทธิภาพควบคู่กับมวลสารซึ่งจะช่วยให้การวัดเชิงปริมาณของไอออนแต่ละModi ไฟในการเปรียบเทียบกับรวม cytosine (41, 47) แต่เทคนิคนี้จะถูก จำกัด โดยไม่สามารถที่จะ map
cytosine ไพเพอร์ Modi สายการใด ๆ ที่ระบุไว้คสถานทีจีโนม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วัดพิจีโนม
อย่างชัดเจน การเปลี่ยนแปลงกับพิจีโนมเล่นบทบาทพื้นฐานในการพัฒนากฎระเบียบพื้นฐาน และประสบการณ์ -
ขึ้นอยู่กับการเปลี่ยนแปลงของระบบประสาททั้ง อย่างไรก็ตาม ขออีกคำถาม : วิธีที่เราสามารถเริ่มต้นที่จะเข้าใจซึ่ง
Epigenetic Modi จึงมีความสำคัญ ซึ่ง Modi แคตไอออนเราจึงจะขอจัดการ
เป็นส่วนหนึ่งของกลยุทธ์ pharmacoepigenomic ? ในความจริงแล้ว คำตอบของคำถามนี้อยู่ในความสามารถของเราที่จะเชื่อมโยง speci จึง C
Epigenetic Modi จะไม่ต่อเนื่องจึงทำให้ลอง ผล เป็น เดอ จึงลงในหัวข้อ druggable พิจีโนม .
ละเอียดเบสเดี่ยว : ภาษาของดีเอ็นเอ methylome เป็น dominated โดย Modi จึงทำให้ที่ OC -
สุนัขที่เดี่ยวเบสไซโทซีน . ดังนั้นมันเป็นสิ่งจำเป็นเพื่อวัดการเปลี่ยนแปลง Epigenetic ด้วยเทคนิคที่
จับภาพความละเอียดนี้ นักวิทยาศาสตร์ตรวจสอบพิจีโนมได้นานใช้ bisul จึงเทลำดับสืบ
โมดิ จึงย้ายถิ่นฐานในแต่ละชนิดที่ดีเอ็นเอ วิธีการนี้ได้พิสูจน์แล้วว่าเป็นประโยชน์สำหรับการสอบสวน
จากสถานะของบุคคลย้ายถิ่นฐานใน DNA ( 32 , 34 , 36 )แม้ว่า bisul จึงเทลำดับเคยจำกัด
โดยความจริงที่ว่าทั้ง MC และ HMC จะยังคงอยู่ในช่วง bisul จึงเตรักษา ( 44 ) ล่าสุดวิธีการสร้าง
เมื่อวิธีการนี้เพื่อให้แยกและการ hydroxymethylation glycerol ( 45 , 46 ) สองวิธีสำหรับการประมาณค่าแบบช่วง
methylation ดีเอ็นเอ hydroxymethylation เกี่ยวข้องกับสูง -
นานาชาติหรือการทำงานของเหลวโครมาโทกราฟีควบคู่กับมวลสาร ซึ่งช่วยให้สามารถวัดประจุของ
แต่ละ Modi จึงเปรียบเทียบกับไซโทซีนรวมเชิงปริมาณ ( 41 , 47 ) อย่างไรก็ตาม เทคนิคนี้จะถูก จำกัด โดยไม่สามารถแผนที่
ย้ายถิ่น Modi จึงใด ๆจึงทำให้ประเภท C -
จีโนม .