Sandaracinus amylolyticus gen. nov.

Sandaracinus amylolyticus gen. nov., sp. nov., a starch-degrading soil myxobacterium, and description of Sandaracinaceae fam. nov.
Kathrin I. Mohr1, Ronald O. Garcia2,3, Klaus Gerth1, Herbert Irschik1 and Rolf Müller1,2,3
+ Author Affiliations

1Department of Microbial Drugs, Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), Inhoffenstraße 7, D-38124 Braunschweig, Germany
2Department of Microbial Natural Products, Helmholtz Institute for Pharmaceutical Research Saarland (HIPS) – Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), Saarland University, Campus C2 3 66123 Saarbrücken, Germany
3Department of Pharmaceutical Biotechnology, Saarland University, Campus C2 3 66123 Saarbrücken, Germany
Correspondence
Rolf Müller [e-mail]
Abstract

A novel starch-degrading myxobacterium designated NOSO-4T (new organism of the Sorangiineae strain 4) was isolated in 1995 from a soil sample containing plant residues, collected in Lucknow, Uttar Pradesh, India. The novel bacterium shows typical myxobacterial characteristics such as Gram-negative, rod-shaped vegetative cells, swarming colonies, fruiting body-like aggregates and bacteriolytic activity. The strain is mesophilic, strictly aerobic and chemoheterotrophic. Based on 16S rRNA gene sequences, NOSO-4T shows highest similarity (96.2 %) with the unidentified bacterial strain O29 (accession no. FN554397), isolated from leek (Allium porrum) rhizosphere, and to the myxobacteria Jahnella thaxteri (88.9 %) and Chondromyces pediculatus (88.5 %). Major fatty acids are C17 : 1 2-OH, C20 : 4ω6 (arachidonic acid), and the straight-chain fatty acids C17 : 0, C15 : 0 and C16 : 0. The genomic DNA G+C content of the novel isolate is 66.8 mol%. It is proposed that strain NOSO-4T represents a novel species in a new genus, i.e. Sandaracinus amylolyticus gen. nov., sp. nov., but also belongs to a new family, Sandaracinaceae fam. nov. The type strain of the type species, S. amylolyticus sp. nov., is NOSO-4T ( = DSM 53668T = NCCB 100362T).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Sandaracinus amylolyticus ทั่วไปพฤศจิกายน sp.พฤศจิกายน เป็นแป้งลดของด myxobacterium และคำอธิบายของ Sandaracinaceae fam. novKathrin I. Mohr1 โรนัลด์โอ Garcia2, 3, Gerth1 คลัส เฮอร์เบิร์ต Irschik1 และ Rolf Müller1, 2, 3+ เข้าสังกัดผู้เขียน1Department ยาจุลินทรีย์ Helmholtz ศูนย์วิจัยเชื้อ (HZI), Inhoffenstraße 7, D-38124 เบราน์ชไวก์ เยอรมนี2Department ของจุลินทรีย์ธรรมชาติผลิตภัณฑ์ Helmholtz สถาบันวิจัยยา Saarland (สะโพก) – ศูนย์วิจัยการติดเชื้อ (HZI), มหาวิทยาลัย Saarland, C2 วิทยาเขต Helmholtz 3 66123 Saarbrücken เยอรมนี3Department ยาเทคโนโลยีชีวภาพ มหาวิทยาลัย Saarland วิทยาเขต C2 3 66123 Saarbrücken เยอรมนีติดต่อMüller Rolf [e-mail]บทคัดย่อMyxobacterium องค์กรการลดแป้งนวนิยาย NOSO กำหนด 4 ที (มีชีวิตใหม่ของสายพันธุ์ Sorangiineae 4) แยกต่างหากจากตัวอย่างดินที่ประกอบด้วยการตกค้างของพืช 1995 รวบรวมในลัคนาว รัฐอุตตรประเทศ อินเดีย แบคทีเรียนวนิยายแสดง myxobacterial ลักษณะทั่วไปเช่นแบคทีเรียแกรมลบ ร็อดรูปผักเรื้อรังเซลล์ swarming อาณานิคม ผลเหมือนร่างกาย fruiting และกิจกรรม bacteriolytic พันธุ์เป็น mesophilic เต้นแอโรบิกอย่างเคร่งครัดและ chemoheterotrophic ตามลำดับ 16S rRNA ยีน NOSO-4 ทีแสดงความคล้ายคลึงกันสูงสุด (ร้อยละ 96.2) กับสายพันธุ์แบคทีเรียไม่ O29 (ทะเบียนไม่ FN554397), แยกต่างหาก จากไรโซสเฟียร์ขนมจีบ leek (ต้น porrum) และ thaxteri Jahnella myxobacteria (88.9%) และ Chondromyces pediculatus (88.5%) กรดไขมันสำคัญ C17: 1 ที่ 2-OH, C20: 4ω6 (กรด arachidonic), และกรดไขมันโซ่ตรง C17: 0, C15: 0 และ C16: 0. genomic DNA G + C เนื้อหาของแยกนวนิยายเป็นโมล 66.8% จะมีเสนอว่า ต้องใช้ NOSO 4 ทีแสดงถึงชนิดในสกุลใหม่ เช่น Sandaracinus amylolyticus ทั่วไปพฤศจิกายน sp.พฤศจิกายน นวนิยาย แต่ยัง เป็นของ fam. Sandaracinaceae ครอบครัวใหม่ nov ชนิดสายพันธุ์ของชนิดพันธุ์ S. amylolyticus sp.พฤศจิกายน เป็น 4 ที NOSO (= DSM 53668T = NCCB 100362T)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Sandaracinus amylolyticus Gen พฤศจิกายน, SP พฤศจิกายน, myxobacterium ดินย่อยแป้งและรายละเอียดของ Sandaracinaceae Fam พฤศจิกายน
Kathrin I. Mohr1, โรนัลด์ทุม Garcia2,3 เคลาส์ Gerth1 เฮอร์เบิร์ Irschik1 และ Rolf Müller1,2,3
+ ผู้เขียนเกี่ยวโยง1Department ของจุลินทรีย์ยาเสพติด Helmholtz ศูนย์การติดเชื้อการวิจัย (Hzi) Inhoffenstraße 7, D-38124 รอน เยอรมนี2Department ของผลิตภัณฑ์ธรรมชาติของจุลินทรีย์, Helmholtz สถาบันเพื่อการวิจัยยาซาร์ลันด์ (HIPS) - Helmholtz ศูนย์การติดเชื้อการวิจัย (Hzi), ซาร์ลันด์มหาวิทยาลัย C2 วิทยาเขต 3 66123 Saarbrückenเยอรมนี3Department เภสัชกรรมเทคโนโลยีชีวภาพซาร์ลันด์มหาวิทยาลัย C2 วิทยาเขต 3 66123 Saarbrücken เยอรมนีจดหมายRolf Müller [e-mail] บทคัดย่อmyxobacterium ย่อยแป้งนวนิยายที่กำหนดเพื่อเข้าสู่-4T (สิ่งมีชีวิตใหม่ของสายพันธุ์ Sorangiineae 4) ที่แยกได้ในปี 1995 จากตัวอย่างดินที่มีสารพิษตกค้างของพืชที่เก็บรวบรวมในลัคเนา อุตตรประเทศอินเดีย แบคทีเรียนวนิยายแสดงให้เห็นถึงลักษณะ myxobacterial ทั่วไปเช่นแกรมลบรูปแท่งเซลล์พืชอาณานิคมปีนป่าย, ผลมวลรวมของร่างกายเหมือนและกิจกรรม bacteriolytic ความเครียดเป็น mesophilic, แอโรบิกอย่างเคร่งครัดและ chemoheterotrophic ขึ้นอยู่กับ 16S rRNA ลำดับยีนสู่-4T แสดงให้เห็นถึงความคล้ายคลึงกันมากที่สุด (96.2%) มีไม่ปรากฏชื่อ O29 สายพันธุ์แบคทีเรีย (เข้าไม่. FN554397) แยกออกจากต้นหอม (Allium porrum) บริเวณรากและไมโซแบคทีเรีย Jahnella thaxteri (88.9%) และ Chondromyces pediculatus (88.5%) กรดไขมันที่สำคัญ ได้แก่ C17: 1 2-OH, C20: 4ω6 (กรด arachidonic) และตรงห่วงโซ่กรดไขมัน C17: 0, C15: 0 และ C16: 0. จีโนมปริมาณดีเอ็นเอ G + C ของเชื้อรานวนิยายเรื่องนี้เป็น 66.8 mol% มันเป็นเรื่องที่เสนอว่าสายพันธุ์เพื่อเข้าสู่-4T เป็นสปีชีส์ใหม่ในสกุลใหม่คือ Sandaracinus amylolyticus Gen พฤศจิกายน, SP พฤศจิกายน แต่ยังเป็นของครอบครัวใหม่ Sandaracinaceae Fam พฤศจิกายน สายพันธุ์ชนิดของชนิดสายพันธุ์เอ amylolyticus SP พฤศจิกายนเป็นเพื่อเข้าสู่-4T (= DSM 53668T = NCCB 100362T)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

sandaracinus amylolyticus ( พ.ย. sp . , แป้งย่อยสลายดิน myxobacterium , และรายละเอียดของ sandaracinaceae FAM .
. mohr1 แคทริน โรนัลด์ โอ garcia2,3 คลาวส์ gerth1 , เฮอร์เบิร์ทและ irschik1 Rolf M ü ller1,2,3
เขียนเกี่ยวโยง

สาขาจุลินทรีย์ ยาเสพติด ศูนย์เพื่อการวิจัยการติดเชื้อเฮล์มโฮลทซ์ ( hzi ) inhoffenstra ß E 7 , d-38124
บราวชไวค์ , เยอรมนีภาควิชาเภสัชกรรมผลิตภัณฑ์ธรรมชาติ จุลินทรีย์ สถาบันเพื่อการวิจัยซาร์ลันด์เฮล์มโฮลทซ์ ( สะโพก ) และ เฮล์มโฮลทซ์ศูนย์วิจัยโรคติดเชื้อ ( hzi ) , ซาร์ลันด์มหาวิทยาลัย วิทยาเขต C2 3 66123 germany . kgm เยอรมัน
3department ยาเทคโนโลยีชีวภาพ , ซาร์ลันด์มหาวิทยาลัย วิทยาเขต C2 3 66123 germany . kgm เยอรมัน

ติดต่อ Rolf M ü ller รอล์ฟ เฮล์มโฮลทซ์เลอร์ @

hzi . de บทคัดย่อนิยายแป้งย่อยสลาย myxobacterium เขต noso-4t ( สิ่งมีชีวิตใหม่ของ sorangiineae ความเครียด 4 ) ที่แยกได้จากตัวอย่างดินใน 1995 ที่มีเศษซากพืชเก็บในลัคเนา รัฐอุตตรประเทศ ประเทศอินเดีย ในนวนิยายที่แสดงลักษณะ myxobacterial ทั่วไป เช่น แกรมลบ rod-shaped พืชเซลล์ เข้ามาล่าอาณานิคมติดร่างกาย เช่น มวลรวม และกิจกรรม bacteriolytic . สายพันธุ์ คือ มี อย่างเคร่งครัด แอโรบิค และ chemoheterotrophic . ขึ้นอยู่กับลำดับเบส 16S rRNA ยีน , แสดง noso-4t ความเหมือนสูงสุดยังคงเป็น  % ) กับสายพันธุ์ที่ o29 แบคทีเรีย ( หนังสือไม่ fn554397 ) , แยกจากลีค ( เลี่ยม porrum ) ราก และการ myxobacteria jahnella thaxteri ( 88%   9 ) และ chondromyces pediculatus ( 88.5   % ) กรดไขมันที่สำคัญ c17   :   2-oh อย่างดี 1 ,   :   4 ω 6 ( กรด arachidonic ) และกรดไขมันโซ่ตรง c17   :   0 c15   :   0 และ c16   :   0 ส่วนดีเอ็นเอ G C เนื้อหาของนวนิยายแยกเป็น 66.8 โมล % ขอเสนอว่า noso-4t เมื่อยเป็นนวนิยายชนิดเป็นสกุลใหม่ เช่น sandaracinus amylolyticus ( พ.ย. sp . พ.ย.แต่ยังเป็นของใหม่ ครอบครัว sandaracinaceae FAM พ.ย. ประเภทสายพันธุ์ของชนิดสายพันธุ์ , S . amylolyticus sp . , noso-4t (   =   DSM 53668t   =   nccb 100362t )