4. ConclusionThe library of tandem

4. Conclusion
The library of tandem mass spectra originated from many
publications and our own experiments and consisted of 263 MSn
spectra (mainly MS2 spectra) of 59 cyclic peptides and a few
related compounds, was build for identification of toxins of this
group. The library was tested by means of cross-validation. Tests
demonstrated that the percentage of correct identifications based
on the best-match product ion mass spectra of ’unknowns’ and
references was 70% in a general case and 88% without defective/
‘one-dimension’ spectra, i.e. simple lists of m/z values. However,
incorporation of such spectra in the reference set of mass spectra
in the course of the library validation somewhat increased TPR
(up to 91%). So, the percentage of 88–91% is the principal estimate
for the overall performance of this library.
ESI-MS2 spectra appeared to be rather close to MALDI-ToF/ToF
fragment spectra. Therefore reference spectra of these two groups
may be to a large extent substitutable for one another. So, fragment-
ion variants of MALDI such as the LIFT technique used in this
research have a promise as general techniques of building mass
spectral libraries.
The consideration of the nature of false positive results shows
that this library provides not only a method of choice for identification
of individual cyclopeptides and also one for the group
recognition of individual classes of these toxins. The approach to
identification of cyclopeptides based on mass spectral librarymatching should be the most effective for abundant ‘known
unknown’ compounds. Here de novo identification methods and
related ones taken from genomics/proteomics (see Introduction)
are not required. Also, this database should be enlarged to reliably
determine relatively rare peptides. If this is not the case, the use of
the library in qualitative analysis of real-world samples leads to
group/ambiguous identification results or even no results.
Conflict of interest
There are no conflicts of interest.
Acknowledgement
Nadezhda Medvedeva is thanked for providing the extracts of
cyanobacterial strains.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

4. บทสรุปไลบรารีของแรมสเป็คตรามวลตัวตามกันไปหลายต้นสิ่งพิมพ์และทดลองของเราเอง และประกอบด้วย 263 MSnแรมสเป็คตรา (ส่วนใหญ่เป็น MS2 แรมสเป็คตรา) เปป 59 ทุกรอบและกี่สารที่เกี่ยวข้อง ถูกสร้างสำหรับรหัสของสารพิษนี้กลุ่ม รีได้รับการทดสอบ โดยการตรวจสอบข้าม ทดสอบแสดงว่า เปอร์เซ็นต์ของรหัสที่ถูกต้องตามในการจับคู่ส่วนผลิตภัณฑ์ไอออนมวลแรมสเป็คตราของ 'unknowns' และอ้างอิงได้ 70% ในกรณีทั่วไปและ 88% ไม่ มีชำรุด /'หนึ่งมิติ' แรมสเป็คตรา อย่างเช่นรายการของค่า m/z อย่างไรก็ตามรวมตัวกันของแรมสเป็คตราดังกล่าวในการอ้างอิงชุดแรมสเป็คตรามวลในหลักสูตรของไลบรารีการ ตรวจสอบค่อนข้างเพิ่ม TPR(ถึง 91%) ดังนั้น เปอร์เซ็นต์ของ 88-91% เป็นการประเมินหลักประสิทธิภาพโดยรวมของไลบรารีนี้ESI MS2 แรมสเป็คตราปรากฏ ว่าค่อนข้างใกล้กับ MALDI-ToF/ToFแยกส่วนแรมสเป็คตรา ดังนั้น อ้างอิงแรมสเป็คตราของกลุ่มเหล่านี้สองอาจจะไป substitutable กันขอบเขตขนาดใหญ่ ดังนั้น ส่วน-ย่อยไอออนของ MALDI เช่นเทคนิคการยกที่ใช้ในการนี้วิจัยมีคำเป็นเทคนิคทั่วไปของอาคารโดยรวมไลบรารีสเปกตรัมแสดงการพิจารณาลักษณะของผลบวกเท็จว่า ไลบรารีนี้ให้ไม่เพียงแต่วิธีที่เลือกสำหรับการระบุแต่ละ cyclopeptides และหนึ่งสำหรับกลุ่มการรับรู้ของแต่ละชั้นของสารพิษเหล่านี้ วิธีการidentification of cyclopeptides based on mass spectral librarymatching should be the most effective for abundant ‘knownunknown’ compounds. Here de novo identification methods andrelated ones taken from genomics/proteomics (see Introduction)are not required. Also, this database should be enlarged to reliablydetermine relatively rare peptides. If this is not the case, the use ofthe library in qualitative analysis of real-world samples leads togroup/ambiguous identification results or even no results.Conflict of interestThere are no conflicts of interest.AcknowledgementNadezhda Medvedeva is thanked for providing the extracts ofcyanobacterial strains.

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

4 . สรุป
ห้องสมุดควบคู่มวลสเปกตรัมมาจากสิ่งพิมพ์หลาย
และการทดลองของเราเองและจำนวน 263 MSN
Spectra ( ส่วนใหญ่ MS2 Spectra ) 59 เป็นเปปไทด์และไม่กี่
สีน้ำเงินถูกสร้างชนิดของสารพิษกลุ่มนี้

ห้องสมุดคือการทดสอบโดยวิธีการข้ามการตรวจสอบ ผลการทดสอบพบว่า ค่า

อะไรบ่งบอกถูกต้องตามในที่ดีที่สุดไอออนผลิตภัณฑ์ตรงกับมวลสเปกตรัมของ ' ไม่รู้ '
อ้างอิงเป็น 70% ในคดีทั่วไปและ 88% โดยไม่บกพร่อง /
'one-dimension ' นี้คือง่ายรายการ M / Z ค่า อย่างไรก็ตาม การเปลี่ยนแปลงดังกล่าวใน

อ้างอิงชุดมวลสเปกตรัม ในหลักสูตรของห้องสมุดการตรวจสอบค่อนข้างเพิ่มขึ้น TPR
( ถึง 91% ) ดังนั้น , ร้อยละ 88 - 91 % เป็นหลัก
.สำหรับประสิทธิภาพโดยรวมของห้องสมุดนี้ .
esi-ms2 Spectra ปรากฏจะค่อนข้างใกล้ชิดมา ดิ tof / tof
ชิ้นนี้ . ดังนั้นอ้างอิงสเปกตรัมของทั้งสองกลุ่ม
อาจจะให้ขอบเขตขนาดใหญ่ ซึ่งเป็นตัวแทนของกันและกัน ดังนั้น ~ -
ไอออนแปรมา ดิ เช่น ลิฟท์ เทคนิคที่ใช้ในการวิจัยมี
สัญญาทั่วไปเทคนิคของมวลอาคาร

ผีห้องสมุดการพิจารณาลักษณะของผลลัพธ์ที่เป็นบวกเท็จแสดง
ที่ห้องสมุดนี้มีไม่เพียง แต่เป็นวิธีการของทางเลือกสำหรับประชาชนของแต่ละบุคคลและหนึ่งยัง cyclopeptides

สำหรับกลุ่มการรับรู้ของแต่ละชั้นเรียนของสารพิษเหล่านี้ แนวทางการ cyclopeptides

ตามมวลสเปกตรัม librarymatching ควรจะมีประสิทธิภาพมากที่สุดสำหรับ ' รู้จัก
ชุกชุมไม่รู้จัก ' สารประกอบ ที่นี่อีกครั้งและระบุวิธีการที่คนถ่ายจากไร
/ โปรตีโอมิกส์ ( บทนำ )
ไม่ต้อง นอกจากนี้ ฐานข้อมูลนี้ควรจะขยายการเชื่อถือ
หาดูค่อนข้างยาก ถ้ากรณีนี้ไม่ได้ , ใช้
ห้องสมุดในการวิเคราะห์ตัวอย่างจริงนัก

กลุ่มระบุผลลัพธ์ หรือคลุมเครือแม้กระทั่งไม่มีผลลัพธ์ .
ความขัดแย้งของผลประโยชน์
ไม่มีความขัดแย้ง .

ขอบคุณสำหรับการตอบรับ นาเดซดา medvedeva คือการให้สารสกัดจาก
สายพันธุ์ระบบยู .