Selecting active threshold signific

Selecting active threshold significantly influence the prediction precision of essential proteins. Apparently, the reliability of the dynamic PPI network evidently increases with increasing active threshold. As shown in Table 1, the average GO similarity of the dynamic PPI network increases with increasing active threshold. However, higher active threshold means fewer proteins and fewer essential proteins contained in the dynamic PPI network (Fig.1). The amount of proteins and essential proteins in the dynamic PPI network slowly decreases when the active threshold increases from 0 to 0.8 but rapidly decreases when the active threshold increases from 0.8 to 0.99. This result indicates that 0.8 is a demarcationpoint. Moreover, the dynamic PPI network still contains more than 93% of essential proteins inthestaticPPI networkwhenthe active threshold is 0.8. Therefore,the active threshold is setto 0.8 for the construction of a relatively reliable dynamic PPI network with enough proteins. This relatively high threshold is in accordance with what has been pointed out by Wang et al. (2013) that for each protein, the time points with its highest expression value and with expression value near to the highest one should be regarded as its active time points

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขีดจำกัดการใช้งาน Selecting มีอิทธิพลต่อความแม่นยำในการทำนายของโปรตีนสำคัญมาก เห็นได้ชัด ความน่าเชื่อถือของเครือข่าย PPI ไดนามิกกรีซเพิ่มกับเพิ่มขีดจำกัดการใช้งาน ดังแสดงในตารางที่ 1 เครือข่าย PPI แบบไดนามิกเฉพาะไปเฉลี่ยเพิ่มขึ้นกับการเพิ่มขีดจำกัดการใช้งาน อย่างไรก็ตาม ขีดจำกัดการใช้งานที่สูงหมายถึง โปรตีนน้อยลงและน้อยลงจำเป็นโปรตีนที่อยู่ในเครือข่าย PPI แบบไดนามิก (ภาพ) จำนวนโปรตีนและโปรตีนที่สำคัญในเครือข่าย PPI ไดนามิกช้าลดเมื่อขีดจำกัดการใช้งานเพิ่มขึ้นจาก 0 0.8 แต่ลดลงอย่างรวดเร็วเมื่อขีดจำกัดการใช้งานเพิ่มขึ้นจาก 0.8 0.99 ผลลัพธ์นี้บ่งชี้ว่า 0.8 เป็น demarcationpoint นอกจากนี้ เครือข่าย PPI แบบไดนามิกยังคงประกอบด้วยมากกว่า 93% โปรตีนสำคัญ inthestaticPPI networkwhenthe ใช้งานขีดจำกัดเป็น 0.8 ดังนั้น ขีดจำกัดการใช้งานเป็น setto 0.8 สำหรับการก่อสร้างของเครือข่าย PPI ไดนามิกค่อนข้างเชื่อถือได้มีโปรตีนเพียงพอ ขีดจำกัดนี้ค่อนข้างสูงคือ ตามที่ได้รับชี้ให้เห็นโดย Wang et al. (2013) ว่า สำหรับแต่ละโปรตีน จุดเวลา กับค่าของนิพจน์สูงสุด และค่านิพจน์ใกล้หนึ่งสูงสุดควรถือเป็นจุดของเวลาที่ใช้งานอยู่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

เลือกเกณฑ์การใช้งานอย่างมีนัยสำคัญที่มีอิทธิพลต่อความแม่นยำในการทำนายของโปรตีนที่สำคัญ เห็นได้ชัดว่าความน่าเชื่อถือของเครือข่าย PPI แบบไดนามิกอย่างเห็นได้ชัดเพิ่มขึ้นกับการเพิ่มเกณฑ์การใช้งาน ดังแสดงในตารางที่ 1 ความคล้ายคลึงกัน GO เฉลี่ยของเครือข่ายแบบไดนามิก PPI เพิ่มขึ้นกับการเพิ่มเกณฑ์การใช้งาน อย่างไรก็ตามเกณฑ์การใช้งานที่สูงขึ้นหมายถึงโปรตีนน้อยลงและโปรตีนที่จำเป็นน้อยลงที่มีอยู่ในเครือข่าย PPI แบบไดนามิก (รูปที่ 1) ปริมาณของโปรตีนและโปรตีนที่สำคัญในเครือข่ายของ PPI แบบไดนามิกอย่างช้า ๆ ลดลงเมื่อเกณฑ์การใช้งานที่เพิ่มขึ้น 0-0.8 แต่ลดลงอย่างรวดเร็วเมื่อมีการใช้งานเพิ่มขึ้นเกณฑ์ 0.8-0.99 ผลที่ได้นี้แสดงให้เห็นว่า 0.8 เป็น demarcationpoint นอกจากนี้เครือข่าย PPI แบบไดนามิกยังคงมีมากกว่า 93% ของโปรตีนที่จำเป็น inthestaticPPI networkwhenthe เกณฑ์ที่ใช้งานอยู่ 0.8 ดังนั้นเกณฑ์ที่ใช้งานอยู่เป็น Setto 0.8 สำหรับการก่อสร้างเครือข่าย PPI ที่ค่อนข้างเชื่อถือได้แบบไดนามิกที่มีโปรตีนเพียงพอ ซึ่งเกณฑ์ที่ค่อนข้างสูงเป็นไปตามสิ่งที่ได้รับการชี้ให้เห็นโดย Wang และคณะ (2013) ว่าสำหรับแต่ละโปรตีนจุดเวลาที่มีค่าการแสดงออกสูงสุดและมีมูลค่าการแสดงออกใกล้กับหนึ่งในที่สูงที่สุดควรจะถือว่าเป็นจุดที่เวลาในการใช้งาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การเลือกใช้งาน N เริ่มมีอิทธิพลต่อการทำนายที่แม่นยำของโปรตีนที่จำเป็น เห็นได้ชัดว่า ความน่าเชื่อถือของเครือข่ายแบบไดนามิกโดย PPI เพิ่มขึ้น เมื่อใช้เกณฑ์ ดังแสดงในตารางที่ 1 เฉลี่ย ความเหมือนของแบบไดนามิกไป PPI เครือข่ายเพิ่มขึ้น เมื่อใช้เกณฑ์ อย่างไรก็ตามสูงกว่าเกณฑ์ หมายถึงโปรตีนที่ใช้งานน้อยลงและน้อยกว่าที่จำเป็นโปรตีนที่มีอยู่ในเครือข่าย ppi แบบไดนามิก ( ” ) ปริมาณของโปรตีน และโปรตีนที่สําคัญในเครือข่าย ppi แบบไดนามิกค่อยๆลดลงเมื่อใช้เกณฑ์เพิ่มจาก 0 ถึง 0.8 แต่อย่างรวดเร็วจะลดลงเมื่อใช้เกณฑ์เพิ่มขึ้นจาก 0.8 ถึง 0.99 . ผลที่ได้นี้แสดงว่า 0.8 เป็น demarcationpoint .นอกจากนี้เครือข่ายแบบไดนามิกซึ่งยังคงมีมากกว่า 93% ของโปรตีนที่จำเป็น inthestaticppi networkwhenthe ปราดเปรียวธรณีประตูคือ 0.8 . ดังนั้น เกณฑ์ที่ใช้เป็นเซ็ต 0.8 สำหรับการก่อสร้างที่เชื่อถือได้ค่อนข้าง Dynamic PPI เครือข่ายที่มีโปรตีนเพียงพอ เกณฑ์ที่ค่อนข้างสูงนี้ จะสอดคล้องกับสิ่งที่ได้รับชี้ให้เห็นโดย Wang et al . ( 2013 ) ที่ให้โปรตีนแต่ละเวลาจุด ด้วยมูลค่า สูงสุด และด้วยการแสดงออกสีหน้าค่าใกล้ที่สุดควรจะถือว่าเป็นจุดที่ใช้งานเวลา