3.1. Identification and classificat

3.1. Identification and classification of Hsf genes in the citrus genome
CDS sequences corresponding to putative Hsf genes from citrus
(CcHsfs) were searched in the C. clementina genome database, and 29
genes encoding putative CcHsf proteins were identified. All candidate
CcHsf proteins were surveyed, and incomplete sequences were
removed. This resulted in the selection of 18 complete sequences.
These CcHsf genes were distributed on seven of the nine putative citrus
chromosomes, excluding chromosomes 4 and 8, with the largest
number, comprised of five CcHsf genes, located on chromosome 2. The
molecular weight of the deduced proteins varied from 24.08 to
56.29 kDa (Table 2).
To investigate the evolution of CcHsfs, an unrooted phylogenetic tree
was generated by using the 18 C. clementina Hsfs, 23 Solanum
lycopersicum Hsfs (SIHsfs) and 21 Arabidopsis thaliana Hsfs (ATHsfs)
(Fig. 1). These Hsf members were clearly grouped into three different
clades corresponding to the main Hsf classes A, B and C. Within the
A-type clade, nine distinct sub-clades were resolved, all of which
comprised the citrus Hsf sequences. Five sub-clades were resolved
within the B-type clade, each sub-clade containing at least one citrus
Hsf sequence. The C-type Hsfs from the three plant species also

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.1. การระบุและจำแนกประเภทของ Hsf ยีนในกลุ่มส้มซีดีลำดับที่สอดคล้องกับยีน Hsf putative จากส้ม(CcHsfs) ถูกค้นหาในฐานข้อมูลจีโนม C. clementina และ 29มีระบุยีนที่เข้ารหัสโปรตีน CcHsf putative ผู้สมัครทั้งหมดโปรตีน CcHsf ได้สำรวจ และมีลำดับที่ไม่สมบูรณ์เอาออก ส่งผลให้การเลือกลำดับ 18 สมบูรณ์ยีนเหล่านี้ CcHsf มีกระจายในเจ็ดส้ม putative เก้าchromosomes รวม chromosomes 4 และ 8 กับใหญ่ที่สุดหมายเลข ประกอบด้วยห้า CcHsf ยีน ตั้งอยู่บนโครโมโซม 2 ที่น้ำหนักโมเลกุลของโปรตีน deduced จาก 24.08 เพื่อที่แตกต่างกัน56.29 kDa (ตาราง 2)การวิวัฒนาการของ CcHsfs ทรี phylogenetic unrooted การตรวจสอบสร้างโดย 18 C. clementina Hsfs, 23 Solanumlycopersicum Hsfs (SIHsfs) และ 21 Arabidopsis thaliana Hsfs (ATHsfs)(Fig. 1) Hsf สมาชิกเหล่านี้ถูกจัดกลุ่มเป็นสามแตกต่างกันชัดเจนclades ที่สอดคล้องกับคลา Hsf หลัก A, B และ c ภายในA ชนิด clade เก้า clades ย่อยทั้งหมดถูกแก้ไข ที่ประกอบด้วยลำดับ Hsf ส้ม Clades ห้าย่อยถูกแก้ไขภายใน clade B ชนิด clade ย่อยแต่ละที่ประกอบด้วยส้มน้อยHsf ลำดับ Hsfs C ชนิดจากสามปลูกพันธุ์ยัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

3.1 การจำแนกชนิดและการจัดหมวดหมู่ของยีน HSF ในจีโนมส้ม
CDS ลำดับสอดคล้องกับยีน HSF สมมุติจากส้ม
(CcHsfs) ถูกค้นในฐานข้อมูลจีโนมซี Clementina 29
และยีนโปรตีนCcHsf สมมุติที่ถูกระบุ ผู้สมัครทั้งหมดโปรตีน CcHsf ได้ทำการสำรวจและลำดับที่ไม่สมบูรณ์ถูกลบออก นี้ส่งผลในการเลือก 18 ลำดับที่สมบูรณ์. ยีน CcHsf เหล่านี้ถูกกระจายในเจ็ดเก้าส้มสมมุติโครโมโซมไม่รวมโครโมโซม4 และ 8 มีที่ใหญ่ที่สุดจำนวนประกอบด้วยห้าCcHsf ยีนอยู่บนโครโมโซม 2. น้ำหนักโมเลกุล โปรตีนอนุมานได้แตกต่างกันที่จะ 24.08 จาก56.29 กิโลดาลตัน (ตารางที่ 2). เพื่อศึกษาวิวัฒนาการของ CcHsfs, ต้นไม้สายวิวัฒนาการ unrooted ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ 18 ซี Clementina Hsfs 23 Solanum lycopersicum Hsfs (SIHsfs) และ 21 Arabidopsis thaliana Hsfs (ATHsfs ) (รูปที่ 1). เหล่าสมาชิก HSF ถูกแบ่งออกเป็นสามอย่างชัดเจนที่แตกต่างกันclades สอดคล้องกับหลัก HSF เรียน A, B และ C ภายในA-ประเภท clade เก้า clades ย่อยที่แตกต่างกันได้รับการแก้ไขซึ่งทั้งหมดประกอบด้วยส้มลำดับHSF ห้า clades ย่อยได้รับการแก้ไขภายในclade B ชนิดย่อยแต่ละ clade ที่มีอย่างน้อยหนึ่งส้มลำดับHSF Hsfs ประเภท C จากสามสายพันธุ์พืชยัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.1 . การจำแนกยีนในจีโนม hsf ส้ม
ซีดีลำดับสอดคล้องกับการแสดงออก hsf ยีนจากส้ม
( cchsfs ) ถูกค้นหาใน C . เคลเมนตีนาจีโนมฐานข้อมูลและ 29
ยีนซึ่ง cchsf การเข้ารหัสโปรตีนมีการระบุ . โปรตีนทั้งหมด cchsf ผู้สมัคร
สํารวจและสมบูรณ์ลำดับถูก
ลบออก นี้ส่งผลในการเลือกลำดับ
18 สมบูรณ์ยีน cchsf เหล่านี้กระจายอยู่ในเจ็ดของเก้าซึ่งส้ม
โครโมโซม โครโมโซม 4 และ 8 รวมกับตัวเลขที่ใหญ่ที่สุด
, ประกอบด้วยห้า cchsf ยีนที่อยู่บนโครโมโซม 2
น้ำหนักโมเลกุลของโปรตีนที่ได้จาก 24.08

มีขนาดแตกต่างกัน ( ตารางที่ 2 ) เพื่อศึกษาวิวัฒนาการของ cchsfs
,
phylogenetic ต้นไม้ unrooted ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ 18 Cเคลเมนตีนา hsfs 23 โซลานัม
lycopersicum hsfs ( sihsfs ) และ 21 Arabidopsis thaliana hsfs ( athsfs )
( รูปที่ 1 ) สมาชิก hsf เหล่านี้ ก็จัดเป็นสาม clades แตกต่างกัน
ที่สอดคล้องกับหลัก hsf คลาส A , B และ C ภายใน
เอ clade , เก้า clades ย่อยที่แตกต่างกันถูกแก้ไข ซึ่งประกอบด้วยส้ม
hsf ลำดับ 5 ซับ clades ถูกแก้ไขภายในประเภท clade
,ย่อยแต่ละ clade ที่มีอย่างน้อยหนึ่งส้ม
hsf ลำดับ ส่วนประเภท hsfs จากสามชนิดของพืชยัง