Secretion of the protein is further

Secretion of the protein is further confirmed by the fact that the
PR-1 protein-related peptide (n-TWDDTVAAYA(I/L)NYANQR-c)
was determined in a sample from pitcher fluid. Its aa sequence is
well-fitting to the deduced sequence of NmPR-1 (aa 51–68;
Fig. 1A); the deduced sequence also indicated a Leu at position
61. Only two N-terminal aspartate residues identified in the peptide
are replaced by asparagine in the deduced sequence. This
might be due to the fact that the micro-sequencing was done on
pooled proteins from different Nepenthes species (Rottloff et al.,
2011). A single nucleotide exchange in the codon GA[U/C] to
AA[U/C] (asparagine) causes an exchange from Asp to Asn and is
easily conceivable within the evolution of Nepenthes species.
As the 3D-structure of a PR-1 protein from tomato, P14a, is
solved by NMR-analysis (Fernández et al., 1997), the spatial structure
of the NmPR-1 was modeled by comparative modeling using
the sequence of that tomato P14a protein (Swiss Prot: P04284)
as homologous template structure. Considering the level ofsequence similarities between the template and NmPR-1, the model
was obviously evaluated to be a good quality structure employing
SWISS-MODEL web server. The modeled residue range was
without the signal peptide. The sequence of NmPR-1 was then
structurally compatible with the fold of PR-1 proteins. Similar to
other PR-1, the predicted NmPR-1 structure was composed of four
a-helices and five b-strands, four of which forming a b-sheet localized
in the same plane and surrounded by the a-helices. Thus, the
typical architecture of PR-1 proteins was suggested, an a–b–a
sandwich (Fernández et al., 1997). The predicted fifth b-strand
can be found outside that structure (Fig. 1B) and does not affect
the core structure.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หลั่งของโปรตีนได้รับการยืนยันเพิ่มเติมจากความจริงที่การ1 ประชาสัมพันธ์ที่เกี่ยวข้องกับโปรตีนเปปไทด์ (n-TWDDTVAAYA(I/L)NYANQR-c)พิจารณาในตัวหม้อน้ำ เป็นลำดับของ aaมีมุมการลำดับซึ่งสามารถกล่าวได้ NmPR-1 (aa 51-68รูป 1A); ลำดับซึ่งสามารถกล่าวได้ระบุลิวที่ตำแหน่ง61. เพียงสองขั้ว N อัลคาไลน์ตกค้างพบเปปไทด์จะถูกแทน โดย asparagine ตามลำดับซึ่งสามารถกล่าวได้ นี้อาจเนื่องจากข้อเท็จจริงที่ว่าไมโครลำดับที่ทำบนพูโปรตีนจากหม้อสายพันธุ์ (Rottloff et al.,2011) . เดี่ยวแลกเปลี่ยนในรหัสพันธุกรรม GA [U/C]AA [U/C] (asparagine) ทำให้เกิดการแลกเปลี่ยนจาก Asp การ Asn และเป็นเป็นไปได้อย่างง่ายดายภายในวิวัฒนาการของสายพันธุ์หม้อเป็น 3D-โครงสร้างของโปรตีน PR 1 จากมะเขือเทศ P14aแก้ไข โดย NMR วิเคราะห์ (Fernández et al. 1997), พันธะNmPR-1 สร้างขึ้น โดยใช้โมเดลเปรียบเทียบลำดับของมะเขือเทศที่ P14a โปรตีน (Prot สวิส: P04284)เป็นโครงสร้างแบบเซทจะมี พิจารณาความคล้ายคลึง ofsequence ระดับระหว่างต้นแบบและ NmPR-1 แบบรับการประเมินดีจะเห็นได้ชัดคุณภาพโครงสร้างจ้างสวิสรุ่นเว็บเซิร์ฟเวอร์ เป็นช่วงการสร้างแบบจำลองสารตกค้างโดยเพปไทด์สัญญาณ ลำดับของ NmPR-1 ได้แล้วโครงสร้างได้กับพับของโปรตีน PR-1 คล้ายกับอื่น ๆ ประชาสัมพันธ์-1, NmPR-1 โครงสร้างคาดการณ์ประกอบด้วย 4มี helices และห้าบีเส้น สี่รูปซึ่งแผ่น b แปลในระนาบเดียวกัน และล้อมรอบ ด้วยที่ helices ดังนั้น การสถาปัตยกรรมทั่วไปของโปรตีน PR 1 แนะนำ ตัว a – b – การแซนด์วิช (Fernández et al. 1997) คาดการณ์ที่ห้าสาระ bสามารถพบได้นอกนั้นโครงสร้าง (รูปที่ 1B) และไม่มีผลโครงสร้างหลัก

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การหลั่งของโปรตีนที่ได้รับการยืนยันต่อไปโดยความจริงที่ว่า
PR-1 โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับเปปไทด์ (n-TWDDTVAAYA (I / L) NYANQR-C)
ถูกกำหนดในตัวอย่างจากของเหลวเหยือก ลำดับ AA ของมันคือ
กระชับลำดับอนุมานของ NMPR-1 (AA 51-68;
. รูปที่ 1A); ลำดับอนุมานได้นอกจากนี้ยังชี้ให้เห็นลื้อที่ตำแหน่ง
61 เพียงสองขั้ว N-aspartate ตกค้างที่ระบุไว้ในเปปไทด์
จะถูกแทนที่ด้วย asparagine ในลำดับอนุมาน นี้
อาจจะเป็นเพราะความจริงที่ว่าไมโครลำดับที่กระทำบน
โปรตีนรวบรวมจากหม้อข้าวหม้อแกงลิงชนิดที่แตกต่างกัน (Rottloff et al.,
2011)
แลกเปลี่ยนเดี่ยวเบื่อหน่ายใน codon GA [U / C] เพื่อ AA [U / C] (asparagine) ทำให้เกิดการแลกเปลี่ยนจาก ASP เพื่อ Asn และมีความ
เป็นไปได้อย่างง่ายดายภายในวิวัฒนาการของหม้อข้าวหม้อแกงลิงสายพันธุ์
ในฐานะที่เป็น 3 มิติโครงสร้างของโปรตีน PR-1 จากมะเขือเทศ P14a จะ
แก้ไขได้โดย NMR วิเคราะห์ (Fernández et al., 1997) โครงสร้างเชิงพื้นที่
ของ NMPR-1 เป็นรูปแบบโดยการสร้างแบบจำลองเปรียบเทียบโดยใช้
ลำดับของมะเขือเทศว่า โปรตีน P14a (สวิส Prot: P04284)
เป็นแม่แบบโครงสร้างคล้ายคลึงกัน เมื่อพิจารณาระดับ ofsequence ความคล้ายคลึงกันระหว่างแม่แบบและ NMPR-1 รุ่น
ได้รับการประเมินอย่างเห็นได้ชัดจะเป็นโครงสร้างที่มีคุณภาพดีการจ้างงาน
เว็บเซิร์ฟเวอร์แบบสวิส ช่วงตกค้างย่อมเป็น
โดยไม่ต้องเปปไทด์สัญญาณ
ลำดับของ NMPR-1 ได้แล้ว โครงสร้างเข้ากันได้กับพับของ PR-1 โปรตีน คล้ายกับ
PR-1 อื่น ๆ ที่คาดการณ์ NMPR-1 โครงสร้างประกอบด้วยสี่
A-เอนริเก้และห้า B-เส้นสี่ซึ่งกลายเป็น B-แผ่นภาษาท้องถิ่น
อยู่ในระนาบเดียวกันและล้อมรอบด้วย A-เอนริเก้ ดังนั้น
สถาปัตยกรรมทั่วไปของ PR-1 โปรตีนได้รับการแนะนำ, A-B-A
แซนวิช (Fernández et al., 1997) ที่คาดการณ์ไว้ที่ห้า B-Strand
สามารถพบว่าโครงสร้างภายนอก (รูปที่ 1B.) และไม่ได้ส่งผลกระทบต่อ
โครงสร้างหลัก สี่ซึ่งกลายเป็น B-แผ่นภาษาท้องถิ่น อยู่ในระนาบเดียวกันและล้อมรอบด้วย A-เอนริเก้ ดังนั้นสถาปัตยกรรมทั่วไปของ PR-1 โปรตีนได้รับการแนะนำ, A-B-A แซนวิช (Fernández et al., 1997) ที่คาดการณ์ไว้ที่ห้า B-Strand สามารถพบว่าโครงสร้างภายนอก (รูปที่ 1B.) และไม่ได้ส่งผลกระทบต่อโครงสร้างหลัก สี่ซึ่งกลายเป็น B-แผ่นภาษาท้องถิ่น อยู่ในระนาบเดียวกันและล้อมรอบด้วย A-เอนริเก้ ดังนั้นสถาปัตยกรรมทั่วไปของ PR-1 โปรตีนได้รับการแนะนำ, A-B-A แซนวิช (Fernández et al., 1997) ที่คาดการณ์ไว้ที่ห้า B-Strand สามารถพบว่าโครงสร้างภายนอก (รูปที่ 1B.) และไม่ได้ส่งผลกระทบต่อโครงสร้างหลัก