Horseshoe crabs are marine arthropo

Horseshoe crabs are marine arthropods with a fossil record extending back approximately 450 million years. They exhibit remarkable morphological stability over their long evolutionary history, retaining a number of ancestral arthropod traits, and are often cited as examples of "living fossils." As arthropods, they belong to the Ecdysozoa}, an ancient super-phylum whose sequenced genomes (including insects and nematodes) have thus far shown more divergence from the ancestral pattern of eumetazoan genome organization than cnidarians, deuterostomes, and lophotrochozoans. However, much of ecdysozoan diversity remains unrepresented in comparative genomic analyses. Here we use a new strategy of combined de novo assembly and genetic mapping to examine the chromosome-scale genome organization of the Atlantic horseshoe crab Limulus polyphemus. We constructed a genetic linkage map of this 2.7 Gbp genome by sequencing the nuclear DNA of 34 wild-collected, full-sibling embryos and their parents at a mean redundancy of 1.1x per sample. The map includes 84,307 sequence markers and 5,775 candidate conserved protein coding genes. Comparison to other metazoan genomes shows that the L. polyphemus genome preserves ancestral bilaterian linkage groups, and that a common ancestor of modern horseshoe crabs underwent one or more ancient whole genome duplications (WGDs) ~ 300 MYA, followed by extensive chromosome fusion.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ฮอร์สชูปูเป็น arthropods ทะเลกับฟอสซิลกลับขยายบันทึกประมาณ 450 ล้านปี พวกเขาแสดงความมั่นคงของโดดเด่นมากกว่าประวัติของวิวัฒนาการที่ยาวนาน รักษาจำนวนลักษณะสัตว์ขาปล่องโบราณ และมักมีอ้างเป็นตัวอย่างของ "ชีวิตซากดึกดำบรรพ์" เป็น arthropods พวกเขาเป็นสมาชิกแบบ Ecdysozoa }, ไฟลัมซุปเปอร์โบราณ genomes ตามลำดับ (รวมทั้งแมลงและ nematodes) ฉะนี้ได้แสดง divergence เพิ่มเติมจากรูปแบบโบราณของ eumetazoan องค์กรกลุ่ม cnidarians, deuterostomes และ lophotrochozoans อย่างไรก็ตาม ความหลากหลาย ecdysozoan มากยังคง unrepresented ใน genomic วิเคราะห์เปรียบเทียบ ที่นี่เราใช้กลยุทธ์ใหม่ของแอสเซมบลี novo de รวมและแผนที่ทางพันธุกรรมการตรวจสอบองค์กรของแมงดาทะเลแอตแลนติก Limulus polyphemus จีโนมโครโมโซมขนาด เราสามารถสร้างแผนผังความเชื่อมโยงทางพันธุกรรมของกลุ่มนี้ Gbp 2.7 โดยลำดับเบสดีเอ็นเอนิวเคลียร์ของป่ารวบรวม 34 โคลนเต็มพี่น้อง และพ่อที่ซ้ำเฉลี่ยของ x 1.1 ต่อตัวอย่าง แผนที่รวมถึงเครื่องหมายลำดับและผู้สมัคร 5,775 อาศัยโปรตีนรหัสยีน 84,307 เปรียบเทียบกับอื่น ๆ genomes metazoan แสดงว่า จีโนม L. polyphemus รักษากลุ่มการเชื่อมโยง bilaterian โบราณ ว่า บรรพบุรุษร่วมของฮอร์สชูปูทันสมัยประกอบไปด้วยอย่าง น้อยหนึ่งกลุ่มโบราณทั้ง duplications (WGDs) ~ MYA 300 ตาม ด้วยฟิวชั่นโครโมโซมอย่างละเอียด

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แมงดาทะเลเป็นสัตว์ขาปล้องทางทะเลที่มีการบันทึกฟอสซิลยื่นกลับประมาณ 450 ล้านปีที่ผ่านมา พวกเขาแสดงความมั่นคงทางสัณฐานวิทยาที่น่าทึ่งกว่าประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของพวกเขานาน, การรักษาจำนวนของลักษณะ arthropod บรรพบุรุษและมักจะอ้างว่าเป็นตัวอย่างของ "ฟอสซิลมีชีวิตอยู่." ในฐานะที่เป็นรพพวกเขาอยู่ในเอคไดโซซัว} ซุปเปอร์ไฟลัมโบราณที่มีจีโนมติดใจ (รวมทั้งแมลงและไส้เดือนฝอย) ได้แสดงให้เห็นป่านนี้แตกต่างจากรูปแบบของบรรพบุรุษขององค์กรจีโนม eumetazoan กว่า cnidarians, deuterostomes และ lophotrochozoans แต่มากของความหลากหลาย ecdysozoan ยังคงแนะนำให้รู้จักในการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบ ที่นี่เราใช้กลยุทธ์ใหม่ของการรวมกันเดอโนโวประกอบและการทำแผนที่พันธุกรรมเพื่อตรวจสอบองค์กรของจีโนมโครโมโซมใหญ่ของแมงดาทะเลแอตแลนติก Limulus ฟื เราสร้างแผนที่การเชื่อมโยงทางพันธุกรรมของจีโนมนี้ Gbp 2.7 โดยลำดับดีเอ็นเอนิวเคลียร์จาก 34 ป่าเก็บรวบรวมตัวอ่อนเต็มพี่น้องและพ่อแม่ของพวกเขาที่หมายถึงความซ้ำซ้อนที่ 1.1 เท่าต่อตัวอย่าง แผนที่รวมถึง 84,307 เครื่องหมายลำดับและ 5775 ผู้สมัครอนุรักษ์โปรตีนเข้ารหัสยีน เมื่อเทียบกับจีโนมซึ่งเกี่ยวกับ METAZOA อื่น ๆ ที่แสดงให้เห็นว่าจีโนมแอลฟืแยมกลุ่มเชื่อมโยง bilaterian บรรพบุรุษและที่บรรพบุรุษร่วมของแมงดาทะเลที่ทันสมัย​​ได้รับการอย่างใดอย่างหนึ่งหรือมากกว่าซ้ำซ้อนกันทั้งจีโนมโบราณ (WGDs) ~ 300 มตามด้วยฟิวชั่นอย่างกว้างขวางโครโมโซม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

แมงดาทะเลเป็นสัตว์ขาปล้องทางทะเลกับบันทึกซากฟอสซิลขยายกลับ ประมาณ 450 ล้านปี พวกเขามีลักษณะที่โดดเด่นของประวัติศาสตร์วิวัฒนาการของพวกเขานาน รักษาจำนวนของลักษณะที่ดินของบรรพบุรุษ และมักจะอ้างเป็นตัวอย่างของ " ฟอสซิลมีชีวิต " เป็นแมลง มันเป็นของ ecdysozoa } ,โบราณที่มีลำดับเบสจีโนมซูเปอร์ไฟลัม ( รวมทั้งแมลงและไส้เดือนฝอย ได้ป่านนี้แสดงความแตกต่างจากแบบแผนของบรรพบุรุษของ eumetazoan จีโนมองค์กรกว่าเลอาโคอันดิวเทอโร ตเมีย , และ lophotrochozoans . แต่มากของความหลากหลาย ecdysozoan ยังคง unrepresented ในการวิเคราะห์จีโนมเปรียบเทียบที่นี่เราใช้กลยุทธ์ใหม่ของการรวมกันอีกครั้งประกอบแผนที่พันธุกรรมเพื่อศึกษาโครโมโซมขนาดจีโนมองค์กรของแมงดาทะเลมหาสมุทรแอตแลนติก limulus Polyphemus . เราได้สร้างแผนที่พันธุกรรมของจีโนมโดยลำดับนี้ 2.7 GBP ดีเอ็นเอนิวเคลียร์ 34 ป่าเก็บ เต็มเจริญ และพ่อแม่พี่น้องที่หมายถึงความซ้ำซ้อนของไตรมาส ต่อ ตัวอย่าง แผนที่รวม 84 ,ถ้าลำดับเครื่องหมาย และ 5775 ผู้สมัครเพื่อการเข้ารหัสยีนโปรตีน การเปรียบเทียบจีโนมเมตาซัวอื่นพบว่าพันธุกรรม . Polyphemus รักษาบรรพบุรุษ bilaterian เชื่อมโยงกลุ่ม และบรรพบุรุษของเกือกม้าที่ทันสมัยได้รับหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งโบราณทั้งจีโนมการ ( wgds ) ~ 300 Mya , ตามด้วยฟิวชั่นโครโมโซมอย่างละเอียด