Raw mass spectra data files were su

Raw mass spectra data files were submitted to ProteinPilot software
(v.4.5, AB SCIEX) employing the Paragon Algorithm for peptide
and protein identification. Separate searches were conducted
against the Universal Protein Knowledge Base (UniProtKB, release
2014_09) for Glycine max and Fabaceae, each combined with a
database of common contaminants. The search parameters were
defined as iodoacetamide modified for cysteine alkylation and
trypsin as the digestion enzyme. The criteria for positive protein
identification were proteins with a ProteinPilotTM unused scoreP2,
P95% confidence and with a minimum of three unique peptides

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ส่งมาที่ ProteinPilot ซอฟต์แวร์แฟ้มข้อมูลดิบโดยรวมแรมสเป็คตรา(v.4.5, AB SCIEX) ใช้อัลกอริทึมพารากอนสำหรับเพปไทด์และรหัสโปรตีน ได้ดำเนินการค้นหาแยกต่างหากเทียบกับสากลโปรตีนฐานความรู้ (UniProtKB ปล่อย2014_09) Glycine max และสมุนไพร แต่ละรวมกับการฐานข้อมูลของสารปนเปื้อนทั่วไป พารามิเตอร์การค้นหาได้กำหนดเป็น iodoacetamide ที่ปรับเปลี่ยนการ cysteine alkylation และทริปซินเป็นเอนไซม์ย่อยอาหาร เงื่อนไขสำหรับโปรตีนบวกระบุมีโปรตีนกับ ProteinPilotTM ไม่ได้ใช้ scoreP2P95% ความเชื่อมั่น และ มีอย่างน้อยสามเฉพาะเปป

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มวลไฟล์ข้อมูลสเปกตรัมที่ถูกส่งไปยังซอฟต์แวร์ ProteinPilot ดิบ
(v.4.5, AB SCIEX)
การใช้อัลกอริทึมพารากอนสำหรับเปปไทด์และบัตรประจำตัวที่มีโปรตีน ค้นหาเฉพาะกิจได้ดำเนินการกับฐานความรู้ของโปรตีนสากล (UniProtKB ปล่อย 2014_09) สำหรับถั่วเหลืองและซี้อี้แต่ละรวมกับฐานข้อมูลของสารปนเปื้อนที่พบบ่อย พารามิเตอร์การค้นหาที่ถูกกำหนดให้เป็น iodoacetamide แก้ไขสำหรับ alkylation cysteine ​​และ trypsin เป็นเอนไซม์ย่อยอาหาร เกณฑ์สำหรับโปรตีนบวกประจำตัวประชาชนเป็นโปรตีนที่มี ProteinPilotTM scoreP2 ที่ไม่ได้ใช้ความเชื่อมั่นP95% และมีอย่างน้อยสามเปปไทด์ที่ไม่ซ้ำกัน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ข้อมูลสเปกตรัมมวลไฟล์ RAW ได้ถูกส่งไปยัง proteinpilot ซอฟต์แวร์
( v.4.5 , AB sciex ) โดยใช้ขั้นตอนวิธีของเปปไทด์และพารากอน
รหัสโปรตีน การแยกการทดลอง
กับสากลโปรตีนฐานความรู้ ( uniprotkb ปล่อย
2014_09 ) Glycine max และวงศ์ถั่วแต่ละรวมกับ
ฐานข้อมูลของสารปนเปื้อนทั่วไป พารามิเตอร์การค้นหาถูก
กำหนด iodoacetamide ดัดแปลงสำหรับอัลคิเลชันซิสเตอีนและ
เป็นการย่อยอาหารเอนไซม์เอนไซม์ เกณฑ์การจำแนกโปรตีนเป็นโปรตีน proteinpilottm
บวกกับไม่ได้ใช้ scorep2
% , p95 ความเชื่อมั่น และอย่างน้อยสามเปปา