The purified re-amplified PCRproduc

The purified re-amplified PCR
products were ligated into the pEASY-T3Cloning Vector (TransGene
Biotech, Beijing, China) and the resultant ligation mix was
transformed into Trans1-T1 Phage Resistant Chemically Competent
Cells as per the manufacturer's instructions. The positive clones
were amplified using the above primers with GC clamp and
checked by DGGE. The correct clones were selected for sequencing
(Invitrogen). The sequences were aligned according to BLAST
similarity in order to find the most similar sequences from the
GenBank database. Similarity analyses were performed with
DNAStar and DNAMAN version 4.0; sequences with >97% similarity
were considered as the same phylotype. Phylogenetic analyses
were conducted using MEGA version 4.0 and
the neighbour-joining tree was constructed using Kimura
2-parameter distance with 1000 replicates to produce Bootstrap
values. The sequence types were named according to their genera
(Glo for Glomus and Arc for Archaeospora, etc.). The AMF sequences
that could not be aligned to sequences in the database were
indicated by “Unknown-AMF”.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

PCR เอาต์ใหม่บริสุทธิ์ผลิตภัณฑ์ถูกควบเป็นเวกเตอร์ pEASY T3Cloning (TransGeneเทคโนโลยีชีวภาพ ปักกิ่ง จีน) และผสมไข่ผลแก่เปลี่ยนเป็น Trans1-T1 Phage ทนสารเคมีมีอำนาจเซลล์ตามคำแนะนำของผู้ผลิต โคลนบวกถูกขยายโดยใช้ไพรเมอร์ด้านบน ด้วยแคลมป์ GC และตรวจสอบ โดย DGGE โคลนถูกต้องถูกเลือกสำหรับการจัดลำดับ(Invitrogen) มีจัดลำดับที่ตามระเบิดความคล้ายคลึงกันเพื่อค้นหาลำดับที่คล้ายคลึงกันมากที่สุดจากการฐานข้อมูล GenBank ดำเนินการวิเคราะห์ความคล้ายคลึงกันด้วยDNAStar และ DNAMAN รุ่น 4.0 ลำดับด้วย > 97% คล้ายได้ถือเป็น phylotype เดียวกัน วิเคราะห์ phylogeneticได้ดำเนินการใช้ร็อครุ่น 4.0 และต้นไม้เพื่อนบ้านเข้าร่วมถูกสร้างขึ้นโดยใช้คิมุระโยระยะทาง 2-พารามิเตอร์กับ 1000 เหมือนกับผลิต Bootstrapค่า ชนิดของลำดับมีชื่อตามสกุลของพวกเขา(Glo Glomus และอาร์ Archaeospora ฯลฯ) ลำดับที่ AMFที่อาจไม่สามารถชิดลำดับในฐานข้อมูลตาม "AMF ไม่รู้จัก"

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บริสุทธิ์ PCR ใหม่ขยาย
ผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการ ligated เป็น Peasy-T3Cloning เวกเตอร์ (ยีน
ไบโอเทค, ปักกิ่ง, จีน) และการผสมผสาน ligation ผลถูก
เปลี่ยนเป็น Trans1-T1 Phage ทนพนักงานเจ้าหน้าที่เคมี
เซลล์ตามคำแนะนำของผู้ผลิต โคลนบวก
ถูกขยายโดยใช้ไพรเมอร์ดังกล่าวข้างต้นด้วย GC ยึดและ
ตรวจสอบโดย DGGE โคลนที่ถูกต้องถูกเลือกสำหรับการจัดลำดับ
(Invitrogen) ลำดับถูกจัดชิดตามที่จะระเบิด
ความคล้ายคลึงกันเพื่อหาลำดับคล้ายกันมากที่สุดจาก
ฐานข้อมูล GenBank การวิเคราะห์ความคล้ายคลึงกันได้ดำเนินการกับ
DNAStar และรุ่น DNAMAN 4.0; ลำดับด้วย> 97% คล้ายคลึงกัน
ได้รับการพิจารณาเป็น phylotype เดียวกัน Phylogenetic วิเคราะห์
ถูกดำเนินการโดยใช้รุ่น MEGA 4.0 และ
ต้นไม้เพื่อนบ้านเข้าถูกสร้างขึ้นโดยใช้คิมูระ
ระยะทาง 2 พารามิเตอร์ 1000 ซ้ำในการผลิตเงินทุน
ค่า ประเภทลำดับถูกตั้งชื่อตามจำพวกของพวกเขา
(Glo สำหรับ Glomus และ Arc สำหรับ Archaeospora ฯลฯ ) ลำดับ AMF
ที่ไม่สามารถสอดคล้องกับลำดับในฐานข้อมูลที่ถูก
ระบุโดย "ไม่ทราบ-สารเลว"

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

และกำลังขยาย PCR
ผลิตภัณฑ์ถูกผูกเข้า peasy-t3cloning เวกเตอร์ ( จีนยีน
Biotech , ปักกิ่ง , ) และผสมซึ่งได้กลายเป็น trans1-t1 Ligation

ว่าทนเก่งเคมีเซลล์ตามคำแนะนำของผู้ผลิต โคลน บวก
ถูกขยายการใช้ไพรเมอร์ข้างต้นกับ GC หนีบแล้ว
ตรวจสอบโดยการทดลอง .โคลน ถูกต้องคัดเลือกจัดลำดับ
( Invitrogen ) ลำดับ ชิดตามระเบิด
ความเหมือนเพื่อหาลำดับใกล้เคียงที่สุดจาก
ขนาดฐานข้อมูล การวิเคราะห์ความเหมือนได้ด้วย
dnastar dnaman รุ่น 4.0 และ ลำดับด้วย > 97% ความเหมือน
ถือว่าเป็น phylotype เดียวกัน ซึ่งวิเคราะห์การใช้ Mega เวอร์ชั่น 4.0

และเพื่อนบ้านเข้าร่วม ต้นไม้ที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้คิมูระ
สองระยะทาง 1000 ซ้ำผลิตบู
ค่า ประเภทลำดับถูกตั้งชื่อตามสกุลของพวกเขา
( Glo สำหรับ Glomus อาร์คสำหรับและ archaeospora ฯลฯ ) คนสารเลวลำดับ
ที่ไม่สอดคล้องกับลำดับในฐานข้อมูล (
) ที่ไม่รู้จัก " คนสารเลว "