- ข้อความ
- ประวัติศาสตร์
Diaporthales Diaporthe Multi-Locus
Diaporthales Diaporthe Multi-Locus Sequence Typing (MLST) Phomopsis systematics
Abstract Diaporthe (Phomopsis) species have often been reported as plant pathogens, non-pathogenic endo- phytes or saprobes, commonly isolated from a wide range of hosts. The primary aim of the present study was to resolve the taxonomy and phylogeny of a large collection of Diaporthe species occurring on diverse hosts, either as pathogens, saprobes, or as harmless endophytes. In the present study we investigated 243 isolates using multi- locus DNA sequence data. Analyses of the rDNA internal transcribed spacer (ITS1, 5.8S, ITS2) region, and partial translation elongation factor 1-alpha (TEF1), beta-tubulin (TUB), histone H3 (HIS) and calmodulin (CAL) genes resolved 95 clades. Fifteen new species are described, namely Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangi ferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum, D. schini and D. terebinthifolii. A further 14 new combinations are introduced in Diaporthe, and D. anacardii is epitypified. Although species of Diaporthe have in the past chiefly been distinguished based on host association, results of this study confirm several taxa to have wide host ranges, suggesting that they move freely among hosts, frequently co-colonising diseased or dead tissue. In contrast, some plant pathogenic and endophytic taxa appear to be strictly host specific. Given this diverse ecological behaviour among members of Diaporthe, future species descriptions lacking molecular data (at least ITS and HIS or TUB) should be strongly discouraged.
Abstract Diaporthe (Phomopsis) species have often been reported as plant pathogens, non-pathogenic endo- phytes or saprobes, commonly isolated from a wide range of hosts. The primary aim of the present study was to resolve the taxonomy and phylogeny of a large collection of Diaporthe species occurring on diverse hosts, either as pathogens, saprobes, or as harmless endophytes. In the present study we investigated 243 isolates using multi- locus DNA sequence data. Analyses of the rDNA internal transcribed spacer (ITS1, 5.8S, ITS2) region, and partial translation elongation factor 1-alpha (TEF1), beta-tubulin (TUB), histone H3 (HIS) and calmodulin (CAL) genes resolved 95 clades. Fifteen new species are described, namely Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangi ferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum, D. schini and D. terebinthifolii. A further 14 new combinations are introduced in Diaporthe, and D. anacardii is epitypified. Although species of Diaporthe have in the past chiefly been distinguished based on host association, results of this study confirm several taxa to have wide host ranges, suggesting that they move freely among hosts, frequently co-colonising diseased or dead tissue. In contrast, some plant pathogenic and endophytic taxa appear to be strictly host specific. Given this diverse ecological behaviour among members of Diaporthe, future species descriptions lacking molecular data (at least ITS and HIS or TUB) should be strongly discouraged.
0/5000
พิมพ์ diaporthales diaporthe ลำดับหลายที (mlst) Phomopsis ระบบ
นามธรรม diaporthe ชนิด (Phomopsis) มักจะได้รับรายงานว่าเป็นเชื้อโรคพืชที่ไม่ใช่เชื้อก่อโรคใน Endo phytes หรือ saprobes แยกกันจากหลากหลายของโฮสต์จุดมุ่งหมายหลักของการศึกษาในปัจจุบันก็คือการแก้ปัญหาอนุกรมวิธานและเชื้อชาติของการเก็บรวบรวมขนาดใหญ่ของสายพันธุ์ diaporthe ที่เกิดขึ้นในครอบครัวที่มีความหลากหลายไม่ว่าจะเป็นเชื้อโรค saprobes หรือเป็น endophytes ไม่เป็นอันตราย ในการศึกษาปัจจุบันเราตรวจสอบ 243 ไอโซเลทโดยใช้หลายทีข้อมูลลำดับดีเอ็นเอ การวิเคราะห์ของ rDNA spacer คัดลอกภายใน (its1, 5.8S, ITS2) ภูมิภาคและการแปลบางส่วนปัจจัยการยืดตัว 1-alpha (tef1), เบต้า tubulin (อ่าง), สโตน h3 (ของเขา) และ calmodulin ยีน (ไขมัน) มีมติ 95 clades สิบห้าสายพันธุ์ใหม่จะมีการอธิบายคือ diaporthe arengae, d brasiliensis, d endophytica, d hongkongensis, d inconspicua, d infecunda, d mayteni, d neoarctii, d Oxe, d paranensis, d pseudomangi-ferae, d pseudophoenicicola, d raonikayaporum,d schini และ d terebinthifolii ต่อเนื่อง 14 ชุดใหม่จะถูกนำมาใช้ใน diaporthe และ d anacardii เป็น epitypified แม้ว่าสายพันธุ์ของ diaporthe มีในอดีตได้รับการส่วนใหญ่ประสบความสำเร็จขึ้นอยู่กับโฮสต์สมาคมผลของการศึกษานี้ยืนยันแท็กซ่าหลายครั้งที่จะมีช่วงโฮสต์กว้างบอกว่าพวกเขาย้ายได้อย่างอิสระระหว่างโฮสต์มักร่วมอาณานิคมเนื้อเยื่อโรคหรือตายในทางตรงกันข้ามสาเหตุโรคพืชบางส่วนและแท็กซ่าเอนโดไฟต์ดูเหมือนจะเป็นเจ้าภาพที่เฉพาะเจาะจงอย่างเคร่งครัด ที่กำหนดพฤติกรรมนี้ระบบนิเวศที่มีความหลากหลายในหมู่สมาชิกของ diaporthe คำอธิบายสายพันธุ์ในอนาคตขาดโมเลกุลข้อมูลควรจะหมดแรง (อย่างน้อยและอ่างของเขามัน)
นามธรรม diaporthe ชนิด (Phomopsis) มักจะได้รับรายงานว่าเป็นเชื้อโรคพืชที่ไม่ใช่เชื้อก่อโรคใน Endo phytes หรือ saprobes แยกกันจากหลากหลายของโฮสต์จุดมุ่งหมายหลักของการศึกษาในปัจจุบันก็คือการแก้ปัญหาอนุกรมวิธานและเชื้อชาติของการเก็บรวบรวมขนาดใหญ่ของสายพันธุ์ diaporthe ที่เกิดขึ้นในครอบครัวที่มีความหลากหลายไม่ว่าจะเป็นเชื้อโรค saprobes หรือเป็น endophytes ไม่เป็นอันตราย ในการศึกษาปัจจุบันเราตรวจสอบ 243 ไอโซเลทโดยใช้หลายทีข้อมูลลำดับดีเอ็นเอ การวิเคราะห์ของ rDNA spacer คัดลอกภายใน (its1, 5.8S, ITS2) ภูมิภาคและการแปลบางส่วนปัจจัยการยืดตัว 1-alpha (tef1), เบต้า tubulin (อ่าง), สโตน h3 (ของเขา) และ calmodulin ยีน (ไขมัน) มีมติ 95 clades สิบห้าสายพันธุ์ใหม่จะมีการอธิบายคือ diaporthe arengae, d brasiliensis, d endophytica, d hongkongensis, d inconspicua, d infecunda, d mayteni, d neoarctii, d Oxe, d paranensis, d pseudomangi-ferae, d pseudophoenicicola, d raonikayaporum,d schini และ d terebinthifolii ต่อเนื่อง 14 ชุดใหม่จะถูกนำมาใช้ใน diaporthe และ d anacardii เป็น epitypified แม้ว่าสายพันธุ์ของ diaporthe มีในอดีตได้รับการส่วนใหญ่ประสบความสำเร็จขึ้นอยู่กับโฮสต์สมาคมผลของการศึกษานี้ยืนยันแท็กซ่าหลายครั้งที่จะมีช่วงโฮสต์กว้างบอกว่าพวกเขาย้ายได้อย่างอิสระระหว่างโฮสต์มักร่วมอาณานิคมเนื้อเยื่อโรคหรือตายในทางตรงกันข้ามสาเหตุโรคพืชบางส่วนและแท็กซ่าเอนโดไฟต์ดูเหมือนจะเป็นเจ้าภาพที่เฉพาะเจาะจงอย่างเคร่งครัด ที่กำหนดพฤติกรรมนี้ระบบนิเวศที่มีความหลากหลายในหมู่สมาชิกของ diaporthe คำอธิบายสายพันธุ์ในอนาคตขาดโมเลกุลข้อมูลควรจะหมดแรง (อย่างน้อยและอ่างของเขามัน)
การแปล กรุณารอสักครู่..
อนุกรมวิธานของ Phomopsis Diaporthales Diaporthe โลกัสโพลหลายลำดับพิมพ์ (MLST)
รายงาน Diaporthe นามธรรม (Phomopsis) ชนิดเป็นโรคพืช endo ไม่อุบัติ-phytes หรือ saprobes แยกต่างหากจากโฮสต์โดยทั่วไปมักจะ จุดมุ่งหมายหลักของการศึกษาปัจจุบันมีการ แก้ไขระบบภาษีและ phylogeny ของคอลเลกชันขนาดใหญ่ชนิด Diaporthe ที่เกิดขึ้นบนโฮสต์หลากหลาย เป็น โรค saprobes หรือ เป็นอันตราย endophytes ในการศึกษาปัจจุบัน เราสอบสวน 243 isolates โดยใช้ข้อมูลลำดับดีเอ็นเอหลายโลกัสโพล วิเคราะห์เป็นตัวเว้นที่ rDNA ภายในทับวรรค (ITS1, 5.8S, ITS2) ภูมิภาค และ elongation แปลบางส่วนปัจจัย 1-อัลฟา (TEF1), บีตา-tubulin (อ่าง), ฮิสโตน H3 (HIS) และยีน calmodulin (CAL) แก้ไข 95 clades อธิบายชนิดใหม่ 15 ได้แก่ Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangi ferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum D. schini และ D. terebinthifolii เป็นชุดข้อมูลใหม่ 14 มีการแนะนำใน Diaporthe และ D. anacardii คือ epitypified แม้แตกพันธุ์ Diaporthe มีในอดีต chiefly แล้วต่าง ที่อยู่บนโฮสต์สมาคม ผลของ confirm การศึกษานี้ taxa หลายมีช่วงกว้างโฮสต์ การแนะนำว่า จะย้ายได้อย่างอิสระระหว่างโฮสต์ บ่อย colonising เนื้อเยื่อตาย หรือป่วยร่วม ในทางตรงกันข้าม บางพืชอุบัติ และ endophytic taxa ปรากฏเป็น โฮสต์ specific อย่างเคร่งครัด กำหนดพฤติกรรมนี้ระบบนิเวศที่หลากหลายของ Diaporthe คำอธิบายชนิดในอนาคตขาดข้อมูลโมเลกุล (น้อยของ และเขาหรืออ่างอาบน้ำ) ควรขอท้อ
รายงาน Diaporthe นามธรรม (Phomopsis) ชนิดเป็นโรคพืช endo ไม่อุบัติ-phytes หรือ saprobes แยกต่างหากจากโฮสต์โดยทั่วไปมักจะ จุดมุ่งหมายหลักของการศึกษาปัจจุบันมีการ แก้ไขระบบภาษีและ phylogeny ของคอลเลกชันขนาดใหญ่ชนิด Diaporthe ที่เกิดขึ้นบนโฮสต์หลากหลาย เป็น โรค saprobes หรือ เป็นอันตราย endophytes ในการศึกษาปัจจุบัน เราสอบสวน 243 isolates โดยใช้ข้อมูลลำดับดีเอ็นเอหลายโลกัสโพล วิเคราะห์เป็นตัวเว้นที่ rDNA ภายในทับวรรค (ITS1, 5.8S, ITS2) ภูมิภาค และ elongation แปลบางส่วนปัจจัย 1-อัลฟา (TEF1), บีตา-tubulin (อ่าง), ฮิสโตน H3 (HIS) และยีน calmodulin (CAL) แก้ไข 95 clades อธิบายชนิดใหม่ 15 ได้แก่ Diaporthe arengae, D. brasiliensis, D. endophytica, D. hongkongensis, D. inconspicua, D. infecunda, D. mayteni, D. neoarctii, D. oxe, D. paranensis, D. pseudomangi ferae, D. pseudophoenicicola, D. raonikayaporum D. schini และ D. terebinthifolii เป็นชุดข้อมูลใหม่ 14 มีการแนะนำใน Diaporthe และ D. anacardii คือ epitypified แม้แตกพันธุ์ Diaporthe มีในอดีต chiefly แล้วต่าง ที่อยู่บนโฮสต์สมาคม ผลของ confirm การศึกษานี้ taxa หลายมีช่วงกว้างโฮสต์ การแนะนำว่า จะย้ายได้อย่างอิสระระหว่างโฮสต์ บ่อย colonising เนื้อเยื่อตาย หรือป่วยร่วม ในทางตรงกันข้าม บางพืชอุบัติ และ endophytic taxa ปรากฏเป็น โฮสต์ specific อย่างเคร่งครัด กำหนดพฤติกรรมนี้ระบบนิเวศที่หลากหลายของ Diaporthe คำอธิบายชนิดในอนาคตขาดข้อมูลโมเลกุล (น้อยของ และเขาหรืออ่างอาบน้ำ) ควรขอท้อ
การแปล กรุณารอสักครู่..
ลำดับการพิมพ์พันธุ์ phomopsis systematics
นามธรรม diaporthe ( phomopsis )( mlst ) diaporthales diaporthe multi-locus ได้รับรายงานว่าโรงงาน saprobes เด็กนักเรียนหรือไม่ - pathogenic Endo - phytes แยกออกจากกันโดยทั่วไปความหลากหลายของโฮสต์แบบปรับเปลี่ยนบ่อยมากเป้าหมายหลักของการศึกษาอยู่ในการแก้ไข phylogeny และบริการอื่นๆจากส่วนกลางที่มีการเก็บรวบรวมข้อมูลขนาดใหญ่ที่มีพันธุ์ไม้ diaporthe เกิดขึ้นบนโฮสต์ที่หลากหลายทั้งที่เป็นเด็กนักเรียน saprobes หรือเป็น endophytes ไม่เป็นอันตรายแต่อย่างใด ในการศึกษาในปัจจุบันที่เราได้ตรวจสอบ 243 แยกโดยใช้ข้อมูลตามลำดับดีเอ็นเอแบบมัลติ - สภาพ การวิเคราะห์ rdna ภายใน ที่ถอดสคริปต์แล้วแผ่นคั่น(ของ 1 5.8 S ของ 2 )พื้นที่และบางส่วนการแปล elongation โครงเครื่อง 1 - แอลฟา( tef 1 ) Beta - tubulin (อ่างอาบน้ำ) histone H 3 (ของเขา)และ calmodulin ( CAL )ได้มีมติ 95 clades ยีน สิบห้าสายพันธุ์ใหม่ได้อธิบายไว้ได้แก่ diaporthe arengae D . brasiliensis D . endophytica D . hongkongensis D . inconspicua D . infecunda D . mayteni D . neoarctii D . oxe D . paranensis ferae D . pseudomangi จรดพระนังคัล pseudophoenicicola D . raonikayaporum D .schini D .และ terebinthifolii D .. การใช้ร่วมกันได้อีก 14 แห่งใหม่ที่จะนำเสนอใน diaporthe และ anacardii D .คือ epitypified แม้ว่าสายพันธุ์ของ diaporthe ในอดีตที่ได้รับใช้ความโดดเด่นในการเชื่อมโยงงานสำคัญผลการศึกษานี้หลาย confirm taxa จะมีช่วงกว้างโฮสต์แนะนำว่าพวกเขาเคลื่อนไหวได้อย่างอิสระในโฮสต์เนื้อเยื่อที่ถูกเพื่อนร่วม - colonising โรคหรือตายไปแล้วในทางตรงข้ามโรงงาน taxa pathogenic และ endophytic บางอย่างปรากฏอยู่เป็นโฮสต์ใช้ Linux เพื่อตอบสนองความต้องการเฉพาะอย่างเคร่งครัด ให้การทำงานทางด้านนิเวศวิทยาความหลากหลายแห่งนี้ในหมู่สมาชิกของ diaporthe รายละเอียดเกี่ยวกับสายพันธุ์ในอนาคตแต่ขาดข้อมูลระดับโมเลกุล(เป็นเวลาอย่างน้อยและอ่างอาบน้ำหรือของเขา)ควรจะได้รับกำลังใจอย่างมาก
นามธรรม diaporthe ( phomopsis )( mlst ) diaporthales diaporthe multi-locus ได้รับรายงานว่าโรงงาน saprobes เด็กนักเรียนหรือไม่ - pathogenic Endo - phytes แยกออกจากกันโดยทั่วไปความหลากหลายของโฮสต์แบบปรับเปลี่ยนบ่อยมากเป้าหมายหลักของการศึกษาอยู่ในการแก้ไข phylogeny และบริการอื่นๆจากส่วนกลางที่มีการเก็บรวบรวมข้อมูลขนาดใหญ่ที่มีพันธุ์ไม้ diaporthe เกิดขึ้นบนโฮสต์ที่หลากหลายทั้งที่เป็นเด็กนักเรียน saprobes หรือเป็น endophytes ไม่เป็นอันตรายแต่อย่างใด ในการศึกษาในปัจจุบันที่เราได้ตรวจสอบ 243 แยกโดยใช้ข้อมูลตามลำดับดีเอ็นเอแบบมัลติ - สภาพ การวิเคราะห์ rdna ภายใน ที่ถอดสคริปต์แล้วแผ่นคั่น(ของ 1 5.8 S ของ 2 )พื้นที่และบางส่วนการแปล elongation โครงเครื่อง 1 - แอลฟา( tef 1 ) Beta - tubulin (อ่างอาบน้ำ) histone H 3 (ของเขา)และ calmodulin ( CAL )ได้มีมติ 95 clades ยีน สิบห้าสายพันธุ์ใหม่ได้อธิบายไว้ได้แก่ diaporthe arengae D . brasiliensis D . endophytica D . hongkongensis D . inconspicua D . infecunda D . mayteni D . neoarctii D . oxe D . paranensis ferae D . pseudomangi จรดพระนังคัล pseudophoenicicola D . raonikayaporum D .schini D .และ terebinthifolii D .. การใช้ร่วมกันได้อีก 14 แห่งใหม่ที่จะนำเสนอใน diaporthe และ anacardii D .คือ epitypified แม้ว่าสายพันธุ์ของ diaporthe ในอดีตที่ได้รับใช้ความโดดเด่นในการเชื่อมโยงงานสำคัญผลการศึกษานี้หลาย confirm taxa จะมีช่วงกว้างโฮสต์แนะนำว่าพวกเขาเคลื่อนไหวได้อย่างอิสระในโฮสต์เนื้อเยื่อที่ถูกเพื่อนร่วม - colonising โรคหรือตายไปแล้วในทางตรงข้ามโรงงาน taxa pathogenic และ endophytic บางอย่างปรากฏอยู่เป็นโฮสต์ใช้ Linux เพื่อตอบสนองความต้องการเฉพาะอย่างเคร่งครัด ให้การทำงานทางด้านนิเวศวิทยาความหลากหลายแห่งนี้ในหมู่สมาชิกของ diaporthe รายละเอียดเกี่ยวกับสายพันธุ์ในอนาคตแต่ขาดข้อมูลระดับโมเลกุล(เป็นเวลาอย่างน้อยและอ่างอาบน้ำหรือของเขา)ควรจะได้รับกำลังใจอย่างมาก
การแปล กรุณารอสักครู่..
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.
- He/she makes a real effort to ensure our
- ฉันไม่อยากผิดหวังอีก
- พ่อเป็นคนไม่ขี้บ่น ไม่เรื่องมาก
- ส่งเช็คเงินเดือนไปเซ็นต์ที่กรุงเทพ
- Crowded
- 8. He/she shows confidence and courage t
- ความยุ่งยากคือเราต้องเปิดใช้หลายๆโปรแกรม
- ฉันเคยผ่านความล้มเหลวในชีวิตการแต่งงาน
- 各分岐はネットワークに接続
- You are my Energy when I'm discouraged.
- jerry , may I introduce my teacher Mr.Jo
- I know that you have the right to pick t
- ฉันอยากแนะนำให้เธอไปเที่ยวฮ่องกงในปีใหม่
- right away
- ฉันทำหน้าที่นวดค่ะ
- สภาพแวดล้อมภายในโรงเรียน
- ให้การศึกษาและอบรมเพิ่มเติม
- 各分岐はネットワークを接続
- นั่งรถไปพังงา
- เเละสัตว์ที่ฉันชอบคือสุนัข
- Though many people prefer the warmer sea
- คุณก้าวมาในชีวิตฉัน...ฉันให้ความสำคัญคุณ
- รวย ฉลาด สมปรารถนา มีคาวมสุขลนท่วนฟ้า
- การแสวงหความรู้
